English: Redondoviridae genome structure. The Brisavirus genome illustrated is 3.0 kb with 3 ORFs separated by two intergenic regions. The largest ORF (purple) encodes the putative capsid (ORF1: Cap) protein, the second largest (red) encodes the Replication-associated (ORF2: Rep) protein, and the third (grey) encodes a protein with no known sequence or structural homologue (ORF3). A stem-loop structure (on top) is predicted to form before the beginning of the Rep coding sequence. The loop contains a conserved nonanucleotide motif and is thought to be the Rep recognition site and origin of viral replication.
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