Thermodesulfobacteria
Klasse im Stamm Thermodesulfobacteriota/Desulfobacterota
(Weitergeleitet von Thermodesulfobacteriales)
Die Thermodesulfobacteria sind eine Klasse anaerober, thermophiler und gramnegativer Bakterien. Innerhalb dieser Klasse gibt es eine einzige Ordnung, Thermodesulfobacteriales.[1][2][3][4] Typusgattung ist Thermodesulfobacterium in der Familie Thermodesulfobacteriaceae.[1]
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Thermodesulfobacterium hydrogeniphilum | ||||||||||
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| Wissenschaftlicher Name der Klasse | ||||||||||
| Thermodesulfobacteria | ||||||||||
| Hatchikian et al. 2002 | ||||||||||
| Wissenschaftlicher Name der Ordnung | ||||||||||
| Thermodesulfobacteriales | ||||||||||
| Hatchikian et al. 2002 |
Die Klasse Thermodesulfobacteria ist Mitglied des Phylums Thermodesulfobacteriota[1][2][5] alias Desulfobacterota,[2][3] für das 2001 bis 2021 ebenfalls die Bezeichnung Thermodesulfobacteria (Garrity & Holt 2021) sensu lato gebräuchlich war.[6][7][8]
Die Bakterienzellen der Thermodesulfobacteria sind in der Regel bacillusförmig (stäbchenförmige „Bazillen“).
Systematik
BearbeitenEs gibt einzige Ordnung der Klasse Thermodesulfobacteria, nämlich Thermodesulfobacteriales. Bezüglich der Aufteilung dieser Ordnung in Familien besteht aber noch keine Einigkeit. Eine Konsens-Taxonomie der Klasse[5][4] benutzt folgende Quellen (Stand 28. Dezember 2023):
- L – LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature)[1]
- N – NCBI (National Center for Biotechnology Information)[2]
- G – GTDB (Genome Taxonomy Database)[3]
Synonyme und abweichende Schreibweisen sind in eckigen Klammern angegeben:
Phylum Thermodesulfobacteriota Garrity & Holt 2021(N)
[„Thermodesulfobacteraeota“ Oren et al. 2015,(N) Desulfobacterota Waite et al. 2023(N)]
- Klasse Thermodesulfobacteria Hatchikian et al. 2002(N,L,G)
[„Thermodesulfobacteriia“ Cavalier-Smith 2020,(L) Thermodesulfobacterium group]- Ordnung Thermodesulfobacteriales Hatchikian et al. 2002(N,L,G)
- Familie Thermodesulfobacteriaceae Hatchikian et al. 2002(L,N)
[Thermodesulfatatoraceae Waite et al. 2020(L)]- Gattung Caldimicrobium Miroshnichenko et al. 2009(L,N)
- Spezies Caldimicrobium rimae Miroshnichenko et al. 2009(L,N) (Typus)(L)
- Spezies Caldimicrobium thiodismutans Kojima et al. 2016(L,N)
- Spezies „Caldimicrobium sp002441555“(G)
[„Thermodesulfobacteriaceae bacterium UBA6232“(N)]
– in der NCBI-Taxonomie zu Thermodesulfobacteriaceae ohne Gattungszuordnung- Referenzstamm: UBA6232(N,G)
- Gattung „Geothermobacterium“ Kashefi et al. 2002(L,N)
- Spezies „Geothermobacterium ferrireducens“ Kashefi et al. 2002(L,N) (Typus)(L)
- Gattung Thermodesulfobacterium Zeikus et al. 1995(L,N)
- Spezies Thermodesulfobacterium commune Zeikus et al. 1995(L,N) (Typus)(L)
- Spezies „Thermodesulfobacterium geofontis“ Hamilton-Brehm et al. 2013(L,N)
- Spezies Thermodesulfobacterium hveragerdense Sonne-Hansen & Ahring 2000(L,N)
- Spezies Thermodesulfobacterium hydrogeniphilum Jeanthon et al. 2002(L,N)
- Spezies „Candidatus Thermodesulfobacterium syntrophicum“ Zehnle et al. 2023(L,N)
- Spezies Thermodesulfobacterium thermophilum (Rozanova & Khudyakova 1974) Rozanova & Pivovarova 1995(L,N)
Thermodesulfobacterium mobile (Rozanova & Khudyakova 1974) Rozanova & Pivovarova 1991,(L,N)
Desulfovibrio thermophilus Rozanova & Khudyakova 1974(L,N)]
- Gattung Thermosulfurimonas Slobodkin et al. 2012(L,N)
- Spezies Thermosulfurimonas dismutans Slobodkin et al. 2012(L,N) (Typus)(L)
- Spezies Thermosulfurimonas marina Frolova et al. 2019(L,N)
- Gattung Caldimicrobium Miroshnichenko et al. 2009(L,N)
- Familie „ST65“(G) – provisorische Bezeichnung
– in der NCBI-Taxonomie zu Thermodesulfobacteriaceae- Gattung Thermosulfuriphilus Slobodkina et al. 2017(L,N,G)
– in der LPSN zu Thermodesulfobacteriota ohne Familien-Zuweisung- Spezies Thermosulfuriphilus ammonigenes Slobodkina et al. 2017 (Typus)(L,N,G)
- Referenzstamm: DSM 102941 alias ST65 oder VKM B-2855;(L,N,G)[A. 1]
- Referenzstamm: DSM 102941 alias ST65 oder VKM B-2855;(L,N,G)[A. 1]
- Spezies Thermosulfuriphilus ammonigenes Slobodkina et al. 2017 (Typus)(L,N,G)
- Gattung Thermosulfuriphilus Slobodkina et al. 2017(L,N,G)
- Familie Thermodesulfatatoraceae Waite et al. 2020(L,N,G)
– in der LPSN ein Synonym von Thermodesulfobacteriaceae- Gattung Thermodesulfatator Moussard et al. 2004(L,N,G)
- Spezies Thermodesulfatator atlanticus Alain et al. 2010(L,N,G)
- Referenzstamm: DSM 21156(L,N,G) alias AT1325 oder JCM 15391(L)
- Spezies Thermodesulfatator autotrophicus Lai et al. 2016(L,N,G)
- Spezies Thermodesulfatator indicus Moussard et al. 2004(L,N,G) (Typus)(L)
- Spezies Thermodesulfatator atlanticus Alain et al. 2010(L,N,G)
- Gattung Thermodesulfatator_A(G) – provisorische Bezeichnung
- Spezies „Thermodesulfatator_A atlanticus_A“(G) – provisorische Bezeichnung
- Referenzstamm: HyVt-533(G)
- Spezies …(G)
- Spezies „Thermodesulfatator_A atlanticus_A“(G) – provisorische Bezeichnung
- Gattung „JAADCO01“(G) – provisorische Bezeichnung
- Spezies „JAADCO01 sp013154385“(G) – provisorische Bezeichnung
– in der NCBI-Taxonomie nicht näher klassifiziert zu Thermodesulfobacteriota- Referenzstamm L_MaxBin.001(N,G) [Thermodesulfobacteriota bacterium isolate L_MaxBin.001[10]]
- Spezies „JAADCO01 sp013154385“(G) – provisorische Bezeichnung
- ohne Gattungszuweisung
- Spezies „Unidentified Thermodesulfobacterium group OPB45“(N)
- Spezies „Unidentified Thermodesulfobacterium group OPS7“(N)
- Spezies „Unidentified Thermodesulfobacterium group OPT4“(N)
- Spezies „Unidentified Thermodesulfobacterium group OPT53“(N)
- Gattung Thermodesulfatator Moussard et al. 2004(L,N,G)
- ohne Familienzuweisung
- ohne Gattungszuweisung
- Spezies „Thermodesulfobacteriales bacterium T2R3“(N)
- ohne Gattungszuweisung
- Familie Thermodesulfobacteriaceae Hatchikian et al. 2002(L,N)
- Ordnung Thermodesulfobacteriales Hatchikian et al. 2002(N,L,G)
Phylogenie
BearbeitenDas folgende Kladogramm stellt basiert auf der 16S rRNA nach dem All-Species Living Tree Project (LTP), Stand LTP 106.[11]
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Anmerkungen
BearbeitenEinzelnachweise
Bearbeiten- ↑ a b c d LPSN: Class Thermodesulfobacteria Hatchikian et al. 2002.
- ↑ a b c d NCBI Taxonomy Browser: Thermodesulfobacteria, Details: Thermodesulfobacteria Hatchikian et al. 2002, equivalent: Thermodesulfobacterium group.
- ↑ a b c GTDB: Thermodesulfobacteria (class).
- ↑ a b Charles Thomas Parker: Thermodesulfobacteria Hatchikian et al. 2002 non Thermodesulfobacteria Garrity and Holt 2021, NamesforLife, LLC. 18. August 2022; doi:10.1601/nm.492, Taxon: doi:10.1601/tx.492 (englisch).
- ↑ a b Charles Thomas Parker: Thermodesulfobacteriota corrig. Garrity and Holt 2021, NamesforLife, LLC. 18. August 2022; doi:10.1601/nm.31634, Taxon: doi:10.1601/tx.491 (englisch).
- ↑ George M. Garrity, John G. Holt, E. Claude Hatchikian, Bernard Ollivier, Jean-Louis Garcia: Phylum BIII. Thermodesulfobacteria phy. nov. In: D. R. Boone, R. W. Castenholz (Hrsg.): Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, Band 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria, 2. Auflage, Springer-Verlag, New York 2001, Print ISBN 978-1-4419-3159-7, S. 389–393; Online ISBN 978-0-387-21609-6, doi:10.1007/978-0-387-21609-6_20 (englisch).
- ↑ Aharon Oren, George M. Garrity: Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 71, Nr. 10, 25. Oktober 2021, ISSN 1466-5034; doi:10.1099/ijsem.0.005056, PMID 34694987 (englisch).
- ↑ LPSN: Phylum "Thermodesulfobacteria" Garrity and Holt 2001.
- ↑ BacDive: Thermosulfuriphilus ammonigenes ST65. Auf: DSMZ.
- ↑ NCBI Nucleotide: MAG: Thermodesulfobacteriota bacterium isolate L_MaxBin.001, whole genome shotgun sequencing project, GenBank: JAADCO000000000.1.
- ↑ 'The All-Species Living Tree' Project (LTP): 16S rRNA-based LTP release 106 (full tree) ( des vom 7. Mai 2012 im Internet Archive) Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis. (PDF). SILVA Comprehensive Ribosomal RNA Database (www.arb-silva.de).
