Die ältesten makroskopischen, mehrzelligen, möglicherweise eukaryotischen Fossilien sind 1,5 Mrd. Jahre alt.[2] Die ältesten Fossilien von Lebewesen, die man bisher gefunden hat, stammen dagegen von 3,2 Mrd. Jahren alten Stromatolithen. Diese biogenen Gesteine entstehen aus Biofilmen. In den letzten Jahrzehnten hat sich erwiesen, dass es sich dabei um komplexe Biozönosen handelt, in denen die verschiedensten Prokaryotensymbiotisch zusammenleben.
Es ist nicht bekannt, ob die frühesten Eukaryoten bereits Organellen besaßen (diese wären aufgrund des nachteiligen Oberflächen-Volumen-Verhältnisses nötig gewesen) oder diese erst nach der Erhöhung ihres Organisationsgrades erwerben konnten. Die bekannteste Theorie zur Entstehung der Organellen ist die Endosymbiontentheorie, die besagt, dass Mitochondrien und Chloroplasten sich aus Bakterien entwickelten, welche sich in die frühen Eukaryoten einlagerten.[4][5]
Gene und Stammbäume: ein Handbuch zur molekularen Phylogenetik[8]
↑Eugene V. Koonin: Energetics and population genetics at the root of eukaryotic cellular and genomic complexity. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. 112. Jahrgang, Nr.52, S.15777–15778, doi:10.1073/pnas.1520869112 (pnas.org). Fehler beim Aufruf der Vorlage:Cite journal: Der Parameter 'year', 'month' oder 'day' hat ungültigen Wert.
↑Steven G. Ball, Debashish Bhattacharya, Andreas P. M. Weber: Pathogen to powerhouse. In: Science. 351. Jahrgang, Nr.6274, 2016, S.659–660, doi:10.1126/science.aad8864 (sciencemag.org).
↑Lynn Margulis, Dorion Sagan: Leben: Vom Ursprung zur Vielfalt. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg, Berlin 1997, ISBN 3-8274-0524-6 (Übersetzung der englischsprachigen Originalausgabe von 1995).
↑Lynn Margulis: Die andere Evolution. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg, Berlin 1999, ISBN 3-8274-0294-8 (Übersetzung der englischsprachigen Originalausgabe von 1998).
↑Tom A. Williams, Sarah E. Heaps, Svetlana Cherlin, Tom M. W. Nye, Richard J. Boys, T. Martin Embley: New substitution models for rooting phylogenetic trees. In: Philosophical Transactions of the Royal Society of London B: Biological Sciences. 370. Jahrgang, Nr.1678, 2015, doi:10.1098/rstb.2014.0336 (royalsocietypublishing.org).
↑Anja Spang, Jimmy H. Saw, Steffen L. Jørgensen, Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka, Joran Martijn, Anders E.Lind, Roel van Eijk, Christa Schleper, Lionel Guy, Thijs J. G. Ettema: Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes. In: Nature. 521. Jahrgang, 2015, ISSN0028-0836, S.173–179, doi:10.1038/nature14447, PMID 25945739, PMC 4444528 (freier Volltext).
↑Volker Knoop, Kai Müller: Gene und Stammbäume: ein Handbuch zur molekularen Phylogenetik. 2. Auflage. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2009, ISBN 978-3-8274-2230-9, S.331–333, doi:10.1007/978-3-8274-2230-9.Fehler bei Vorlage * Parametername unbekannt (Vorlage:Cite book): "authorlink2; authorlink1"