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Benutzer Diskussion:Dirk123456/Archiv/2005

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Erstes Diskussionsthema ("p IN DEN CpG- INSELN"; ursprünglich ohne Überschrift)

HALLO ICH HOFFE DU BEKOMMST DIE NACHRICHT;ICH WEISS NÄMLICH NICHT SO GANZ WIE DAS HIER FUNKTIONIERT.VEIGENTLICH HAB ICH NUR EINE KURZE FRAGE: KANNST DU MIR SAGEN WAS DAS p IN DEN CpG- INSELN BEDEUTET? ICH HAB ERLICH SCHON FAST ÜBERALL GESCHAUT,ABER WAS DAS ZU BEDEUTEN HAT IST MIR ECHT EIN RÄTSEL. DANKE BERNADETTE P.S. KANNST DU MIR AUF POSTFUERLENA@WEB.DE ANTWORTEN?

Answer: Ich hab leider auch keine echte Quelle fuer das 'p'. Es ist aber ueblich, die Orientierung mit dem 'p' anzugeben. Die einzelnen Trinukleotide ATP,CTP,GTP und TTP sehen ja eigentlich so aus: P-P-P-5'-Desoxyribose-(jeweilige_Base)-3'. Nun werden bei einer Polymerisation ja die Nukleotide immer mit ihrem 5'-Ende unter Abspaltung von Pyrophosphat (PP) an das phosphatfreie 3'-Ende ligiert. CpG ist also eine Abkürzung von 5'...-p-C-p-G-...3'. Man hat sich wahrscheinlich (in der Originalarbeit?) fuer diese Kurzform entschieden

um 1.) zu markieren, dass es sich nicht um einzelne Nukleotide handelt, sondern um einen Kettenausschnitt (also nicht pCpG)

und um 2.) zu markieren, dass nicht die andere Orientierung 3'...C-p-G-p...5' gemeint ist (also nicht CG).

Ich bin da auch schon mal drueber gestolpert, als ich die ersten paar Mal was ueber CpG-Islands gelesen hatte und hab mir das dann so zusammengereimt. Solche ähnlichen Sachen tauchen ja auch bei anderen Nukleiotidstrukturen auf. Z. B. bei Tetraguanosinphosphat (ppGpp) als Auslöser der 'Stringent Control' bei Bakterien und bei der Beschreibung der Cap-Struktur (3'HO-7mGpppNpNpN...) bei Eukaryoten.

Dntp Desoxyribonukleosidtriphosphat etc.

Hi Dirk! Wir haben uns schon bei der Diskussion um dNTPs und dem Redirect "getroffen". Jetzt ist in der Qualitätssicherung der Artikel Desoxyribonukleosidtriphosphat aufgetaucht. Ich überlege, ob es sinnvoll sein könnte, diesen und auch Nukleosidtriphosphat zu redirecten und in Nukleosid und Nukleotid einzubauen. Das ist sonst alles ein bißschen viel Überschneidung. Sorry für meine Meinung und deine viele Arbeit, sag mal was dazu, bitte! --Mdangers 00:18, 30. Okt 2005 (CEST)

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