DEVD-Sequenz
Mit DEVD wird im Einbuchstabencode die Aminosäuresequenz aus Asparaginsäure-Glutaminsäure-Valin-Asparaginsäure (Asp-Glu-Val-Asp) bezeichnet.
Die DEVD-Sequenz stimmt mit einer Sequenz innerhalb der Poly-ADP-Ribose-Polymerase 1 (PARP-1), einem DNA-Reparatur-Enzym überein. Die Spaltung der DEVD-Sequenz wird durch Caspase-3 während des programmierten Zelltods (Apoptose) katalysiert. In der Biochemie gibt es eine Reihe von verschiedenen Anwendungen der DEVD-Sequenz.
DEVD-Derivate
BearbeitenVerschiedene DEVD-Derivate, wie DEVD-AMC oder DEVD-AFC, werden als fluorimetrisches Assays für die Ermittlung der Enzymaktivität der Caspasen verwendet. Dabei wird ein an DEVD gebundener Fluoreszenzfarbstoff, beispielsweise 7-Amino-4-methylcumarin (AMC), durch die Aktivität der Caspase-3, -6 oder -7 freigesetzt und fluoreszenzspektrometrisch gemessen. Die Intensität des fluoreszierenden Lichtes korreliert direkt mit der Aktivität Caspasen.[1][2]
Mit DEVD-CHO (Asp-Glu-Val-Asp-Aldehyd) und DEVD-fmk (Asp-Glu-Val-Asp-O-Methyl-fluormethylketon) wurden zwei Caspase-Inhibitoren entwickelt. Die N-Acetyl-Variante des DEVD-CHO (AcDEVD-CHO = N-Acetyl-Asp-Glu-Val-Asp-Aldehyd) reduziert die Neurotoxizität der Chemotherapeutika Cisplatin, Cyclophosphamid, Methotrexat, Vinblastin und Thiotepa.[3][4]
Einzelnachweise
Bearbeiten- ↑ M. Garcia-Calvo et al.: Purification and catalytic properties of human caspase family members. In: Cell Death & Differentiation. 6/1999, S. 362–369. PMID 10381624
- ↑ Dovi-Akué DAP, Volatile Anästhetika induzieren Caspase-abhängige Apoptose in Jurkat T-Lymphozyten (PDF; 1,9 MB), Dissertation, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg i. Br., 2005.
- ↑ W. Rzeski et al.: Excitotoxicity and apoptosis mediate neuronal toxicity of cytostatic agents. In: Society for Neuroscience 27th Annual Meeting. Los Angeles 1998.
- ↑ W. Rzeski: Anticancer agents are potent neurotoxins in vitro and in vivo. In: Ann Neurol. 56/2004, S. 351–360. PMID 15349862
Literatur
Bearbeiten- N. Schmidt: Evolution des programmierten Zelltods: Biochemische und immunhistochemische Untersuchungen an Caspasen in Hydra. Dissertation. LMU, München 2003. (edoc.ub.uni-muenchen.de, PDF-Datei; 3,64 MB)
- T. Fernandes-Alnemri: Mch3, a novel human apoptotic cysteine protease highly related to CPP32. In: Cancer Research. 55/1995, S. 6045–6052.
- T. Fernandes-Alnemri: In vitro activation of CPP32 and Mch3 by Mch4, a novel human apoptotic cysteine protease containing two FADD-like domains. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. 93/1996, S. 7464–7469.
- M. Garcia-Calvo et al.: Inhibition of human caspases by peptide-based and macromolecular inhibitors. In: Journal of Biological Chemistry. 273/1998, S. 32608–32613.
- V. Gurtu: Fluorometric and colorimetric detection of caspase activity associated with apoptosis. In: Analytical Biochemistry. 251/1997, S. 98–102.
- V. J. Kidd: Proteolytic activities that mediate apoptosis. In: Annual Review of Physiology. 60/1998, S. 533–573.
- N. Margolin et al.: Substrate and inhibitor specificity of interleukin-1 beta-converting enzyme and related caspases. In: Journal of Biological Chemistry. 272/1997, S. 7223–7228.
- M. Muzio et al.: FLICE, a novel FADD-homologous ICE/CED-3-like protease, is recruited to the CD95 (Fas/APO-1) death - inducing signaling complex. In: Cell. 85/1996, S. 817–827.
- D. W. Nicholson et al.: Identification and inhibition of the ICE/CED-3 protease necessary for mammalian apoptosis. In: Nature. 376/1995, S. 37–43.
- J. Rotonda et al.: The three-dimensional structure of apopain/CPP32, a key mediator of apoptosis. In: Nature Structural Biology. 3/1996, S. 619–625.
- P. Schotte et al.: Non-specific effects of methyl ketone peptide inhibitors of caspases. In: FEBS Letters. 442/1999, S. 117–121.
- R. V. Talanian et al.: Substrate specificities of caspase family proteases. In: Journal of Biological Chemistry. 272/1997, S. 9677–9682.
- R. V. Talanian, H. J. Allen: Roles of caspases in inflammation and apoptosis: prospects as drug discovery targest. In: Annual Reports in Medicinal Chemistry. 33/1988, S. 273–282.
- N. A. Thornberry et al.: A combinatorial approach defines specificities of members of the caspase family and granzyme B. In: Journal of Biological Chemistry. 272/1997, S. 17907–17911.
- P. Villa et al.: Caspases and caspase inhibitors. In: Trends in Biochemical Sciences. 22/1997, S. 388–393.