Diskussion:Argininosuccinat-Synthase

Argininosuccinat-Synthase ist eine Synthase und Synthasen verbrauchen kein ATP und gehören zur EC-4-Klasse. In diesem Artikel geht es um die Argininosuccinatsynthetase (EC-6-, --> Synthetasen sind Ligasen), die die angegebene Reaktion katalysiert und auch zur EC-6-Klasse gehört. Die Argininosuccionatsynthase (EC-4, auch: Argininosuccinat-Lyase --> Lyasen sind Synthasen) setzt das Argininosuccinat im Harnstoffzyklus zu Arginin und Succinat um. Der Artikel enthält also einen großen Fehler, klein zu sehen ... Der Artikel handelt von der Argininosuccinat-Synthetase und nicht der Argininosuccinat-Synthase. Möge jemand den Artikel überarbeiten, bitte. (nicht signierter Beitrag von 141.53.207.54 (Diskussion) 11:47, 22. Sep. 2010 (CEST))

Dieser Irrtum herrscht leider immer noch vor. Die IUBMB beschloss 1983 aufgrund der Verwechslungsgefahr, die Bezeichnung Synthetase nicht mehr zu vergeben (Classification and Nomenclature of Enzymes by the Reactions they Catalyse. In: Enzyme Nomenclature. Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB), abgerufen am 22. September 2010 (englisch): „Consequently NC-IUB decided in 1983 to abandon the use of synthetase for common names, and to replace them with names of the type X-Y ligase. In a few cases in Group 6, where the reaction is more complex or there is a common name for the product, a synthase name is used (e.g. EC 6.3.2.11 and EC 6.3.5.1).“ 

Die Argininosuccinatsynthase (systematischer Name L-citrulline:L-aspartate ligase (AMP-forming) [1]) fällt offensichtlich auch darunter. -- Ayacop 15:41, 22. Sep. 2010 (CEST)

In "Biochemie und Pathobiochemie, Löffler, Springer, 2007" (S.446,447) werden beide Formen, sowohl Argininosuccinat-Synthetase als auch Argininosuccinat-Synthase, verwendet. In "Duale Reihe - Biochemie, Rassow, Thieme, 2006" (S.147) und auch diversen anderen Lehrbüchern der Biochemie (z.B. Biochemie, Müller-Estert, Elsevier, 2004 etc.) wird jedoch nur der Begriff der Argininosuccinat-Synthetase gebraucht. Auch in den Vorlesungen und Skripten an meiner Uni war immer der Begriff der Synthetase gebräuchlich, was aus meiner Sichtweise auch immer logisch mit meinem Grundverständniss der Enzymklassen zu vereinbaren war. Zumindest scheint mir aber die Nutzung des Begriffes "Argininosuccinat-Synthetase" erfahrungsgemäß gebräuchlich.

Zugegebenermaßen kenne ich mich mit der IUBMB nicht aus. Aus dem Zitat geht allerdings auch nur hervor, dass der Begriff Synthetase durch den Begriff (X-Y)Ligase ersetzt wurde. Das stimmt auch und deckt sich mit meinem Wissen. Allerdings heißt der Artikel der Wikipedia auch nicht "Argininosuccinat-Ligase", sondern "Argininosuccinat-Synthase". Auch die Umbenennung auf "Synthase" wird im Zitat nur für "EC 6.3.2.11" und "EC 6.3.5.1" beispielhaft genannt, jedoch nicht für unseren Fall "EC 6.3.4.5".

Abschließend möchte ich darauf hinweisen, dass es in der englischen Wikipedia auch "Argininosuccinat-Synthetase" heißt! Für mich beinhaltet die deutsche Wikipedia hier immer noch große Fehler und wird mich wohl künftig dazu veranlassen, auf die Seiten der englischsprachigen Kollegen zurückzugreifen. (nicht signierter Beitrag von 141.53.207.54 (Diskussion) 22:45, 22. Sep. 2010 (CEST))

Komisch dann nur, dass es in dem zweiten von mir oben angegebenen Link der IUBMB, der speziell auf das Enzym eingeht, "Argininosuccinat-Synthase" heißt, hast du das übersehen? Naja, du kannst es ja dann bei den Engländern verbessern. -- Ayacop 08:43, 23. Sep. 2010 (CEST)

Entschuldigung das hatte ich übersehen. Allerdings steht unter other names und References auch wieder die Synthetase. Bei PubMed findet man bei EC 6.3.4.5 auch die Synthetase. Also bei neueren wissenschaftlichen Publikationen scheint es auch gebräuchlich zu sein. Bei http://expasy.org kann man die EC-Nummer eingeben und findet auch die Synthetase, zumindest als alternativen Namen.

Meine Zusammenfassung: Auch wenn theoretisch "Synthase" der "accepted name" der IUBMB zu sein scheint, wird hier in der Praxis (Bücher, Uni, Wissenschaft) fast ausschließlich der (alternative) Begriff der Synthetase genutzt. Zumindest ein Hinweis darauf sollte zu Beginn des Artikels zu finden sein und möglicherweise eine Aufnahme des alternativen Namens in das grüne Kästchen. (nicht signierter Beitrag von 141.53.207.54 (Diskussion) 13:07, 23. Sep. 2010 (CEST))

Erhellend vielleicht auch der Artikel Synthetase. Evt. sollte man das auf die neue Bezeichnung umändern und die alte Bezeichnung nur im Text erläutern. Allerdings, wenn ich das richtig verstanden habe, müsste es dann direkt Argininosuccinat-Ligase lauten? --Olivhill (Diskussion) 21:24, 16. Jun. 2013 (CEST)

Zwischenschritt?

Sollte man nicht auch etwas genauer auf den Reaktionsweg eingehen? Meines Wissens nach Katalysiert die Argininosuccinat-Syn(the)thase eigentlich nur die Reaktion von Citrullin zu Citrullyl-AMP, welches dann spontan weiterreagiert zu Argininosuccinat. --134.2.187.42 21:48, 6. Jan. 2012 (CET)

Prinzipiell fehlen zu den meisten Enzymartikeln hier biochemisch-mechanistische und noch mehr strukturbiologische Einzelheiten. --Ayacop 09:26, 7. Jan. 2012 (CET)