Die TFIIH-Helikase XPD ist ein Enzym im Zellkern von Pilzen und Tieren, das als Teil des Transkriptionsfaktors IIH (TFIIH) die Öffnung des DNA-Doppelstrangs katalysiert, nachdem der Präinitiationskomplex zusammengebaut wurde. Dieser Reaktionsschritt ist Teil der Initiation der Transkription aller eukaryotischen Gene. Außerdem spielt XPD eine ganz ähnliche Rolle bei der DNA-Reparatur. Mutationen im menschlichen ERCC2-Gen, das für XPD codiert, können zur seltenen Erbkrankheit Xeroderma pigmentosum Typ D führen, bei der das Risiko für Hautkrebs stark erhöht ist, oder zum Tay-Syndrom, einer seltenen Ichthyose, oder zum Cockayne-Syndrom Typ 2.[2]
| TFIIH-Helikase XPD | ||
|---|---|---|
| Eigenschaften des menschlichen Proteins | ||
| Masse/Länge Primärstruktur | 760 Aminosäuren | |
| Kofaktor | Mg2+ | |
| Bezeichner | ||
| Gen-Name | ERCC2 | |
| Externe IDs | ||
| Enzymklassifikation | ||
| EC, Kategorie | 3.6.4.12, Helikase | |
| Reaktionsart | Hydrolyse, Isomerisierung | |
| Substrat | ATP + ds-DNA | |
| Produkte | ADP + Phosphat + ds-DNA mit 'Blase' | |
| Vorkommen | ||
| Homologie-Familie | Hovergen | |
| Übergeordnetes Taxon | Tiere, Pilze[1] | |
| Orthologe | ||
| Mensch | Hausmaus | |
| Entrez | 2068 | 13871 |
| Ensembl | ENSG00000104884 | ENSMUSG00000030400 |
| UniProt | P18074 | O08811 |
| Refseq (mRNA) | NM_000400 | NM_007949 |
| Refseq (Protein) | NP_000391 | NP_031975 |
| Genlocus | Chr 19: 45.35 – 45.37 Mb | Chr 7: 19.38 – 19.4 Mb |
| PubMed-Suche | 2068 | 13871
|
Die Öffnung des Doppelstrangs verbraucht ein Molekül ATP und umspannt die Basen von −10 bis +2 bezüglich des Genanfangs. Unterstützt wird sie durch Entdrillung der DNA (sogenanntes negatives Supercoiling) mithilfe von TFIIE. An der DNA-Reparatur nimmt außerdem die XPB-Helikase teil. Die geöffnete DNA wird in beiden Fällen als DNA-Blase bezeichnet.[3]
XPB und XPD bilden einen Teil der Verteidigung der Zelle gegen retrovirale Infektionen, einer Laborstudie nach. Eine chinesische Studie fand, dass eine Kombination bestimmter XPB- und XPD-Varianten das Lungenkrebsrisiko erhöhte.[4][5]
Literatur
Bearbeiten- Beck BD, Hah DS, Lee SH: XPB and XPD between transcription and DNA repair. In: Adv. Exp. Med. Biol. 637. Jahrgang, 2008, S. 39–46, PMID 19181109.
Einzelnachweise
Bearbeiten- ↑ Homologe bei OMA
- ↑ UniProt P18074
- ↑ Reinberg/reactome: RNA Polymerase II Promoter Opening: First Transition
- ↑ Yoder K, Sarasin A, Kraemer K, McIlhatton M, Bushman F, Fishel R: The DNA repair genes XPB and XPD defend cells from retroviral infection. In: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103. Jahrgang, Nr. 12, März 2006, S. 4622–7, doi:10.1073/pnas.0509828103, PMID 16537383, PMC 1450221 (freier Volltext).
- ↑ Hu Z, Xu L, Shao M, et al.: Polymorphisms in the two helicases ERCC2/XPD and ERCC3/XPB of the transcription factor IIH complex and risk of lung cancer: a case-control analysis in a Chinese population. In: Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 15. Jahrgang, Nr. 7, Juli 2006, S. 1336–40, doi:10.1158/1055-9965.EPI-06-0194, PMID 16835333.