Die Handball-Regionalliga startete in der Saison 1999/2000 mit fünf Ligen: Süd, Südwest, West, Nord und Nordost. Die Neustrukturierung der Regionalliga nach der Saison 1999/2000 sorgte dafür, dass von den angetretenen 104 Vereinen insgesamt 25, also fast ein Viertel, die Klasse verlassen mussten. Die Regionalligen Süd und West lösten ihre zweiten Staffeln auf. Hinzu kam mit der Regionalliga Mitte – für fünf Jahre – eine sechste Regionalliga. Am Ende der Spielzeit stiegen folgende Mannschaften in die 2. Bundesliga auf.

Handball-Regionalliga
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Meister: Nord: Wilhelmshavener HV
Nordost: USV Cottbus II
West: HC 93 Bad Salzuflen
Süd-West: TV Kirchzell
Süd: HSG Kronau/Bad Schönborn
Aufsteiger: alle Meister
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Handball-Oberligen

Regionalliga Nord

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Landkarte Regionalligen: Nordost, Nord, West, Südwest und Süd.
Pl. Verein Sp. Tore Diff. Pkt.
01. Wilhelmshavener HV 30 916:573 +343 60:00
02. TSV Burgdorf 30 798:669 +129 48:12
03. SG HC Emden/RSV 30 797:726 0+71 42:18
04. TSV Bremervörde 30 745:713 0+32 37:23
05. SV Anhalt Bernburg 30 737:681 0+56 34:26
06. SV GW Wittenberg-Piesteritz 30 684:703 0−19 34:26
07. ATSV Habenhausen 30 694:677 0+17 33:27
08. TG 1860 Münden 30 680:705 0−25 33:27
09. Ibbenbürener Spvg (N) 30 701:735 0−34 29:31
10. HG 85 Köthen 30 727:727 00±0 28:32
11. OHV Aurich 30 755:769 0−14 27:33
12. SV Concordia Staßfurt 30 648:699 0−51 24:36
13. SV Langenweddingen (N) 30 670:795 −125 17:43
14. SG Achim/Baden 30 684:819 −135 12:48
15. HSV 05/MTV Rosdorf-Göttingen (N) 30 612:761 −149 12:48
16. Oldenburger TB 30 663:760 0−97 10:50
Legende
Aufsteiger in die 2. Bundesliga
Absteiger in die Oberliga
(N) Aufsteiger aus der Oberliga

Regionalliga Nordost

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Pl. Verein Sp. Tore Diff. Pkt.
01. USV Cottbus 30 775:642 +133 49:11
02. SG Ahlbeck-Heringsdorf (N) 30 709:665 0+44 40:20
03. SG Flensburg-Handewitt II (A) 30 754:694 0+60 38:22
04. SG Niebüll/Süderlügum (N) 30 697:642 0+55 38:22
05. ATSV Stockelsdorf 30 688:666 0+22 36:24
06. DHK Flensborg 30 706:667 0+39 35:25
07. VfL Lichtenrade 30 674:690 0−16 32:28
08. TSV Ellerbek 30 764:735 0+29 30:30
09. TSV Chemie Premnitz 30 673:690 0−17 30:30
10. VfL Bad Schwartau II 30 756:721 0+35 29:31
11. 1. VfL Potsdam (N) 30 654:708 0−54 29:31
12. HC Cottbus 30 701:718 0−17 26:34
13. Büdelsdorfer TSV 30 673:667 00+6 25:35
14. TSV Alt Duvenstedt 30 639:698 0−59 19:41
15. SG Preußen/Lichterfelde (N) 30 590:673 0−83 14:46
16. SG Wilhelmsburg (N) 30 651:779 −128 10:50
Legende
Aufsteiger in die 2. Bundesliga
Absteiger in die Oberliga
(A) Absteiger aus der 2. Bundesliga
(N) Aufsteiger aus der Oberliga

Regionalliga West

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Hauptartikel: Handball-Regionalliga West 1999/2000

Staffel Nord
Pl. Verein Sp. Tore Diff. Pkt.
01. HC 93 Bad Salzuflen 26 703:572 +131 48:40
02. TuS Spenge 26 600:512 0+88 45:70
03. HSG Schwerte-Westhofen 26 601:533 0+68 41:11
04. TuS 97 Bielefeld-Jöllenbeck 26 637:619 0+18 28:24
05. TV Angermund 26 569:541 0+28 27:25
06. DJK Unitas Haan 26 526:548 0−22 27:25
07. TV Oppum (N) 26 577:568 00+9 26:26
08. HSC Eintracht Recklinghausen (N) 26 569:587 0−18 25:27
09. TuS Ferndorf 26 586:588 00−2 24:28
10. Lenneper TG (N) 26 580:593 0−13 22:30
11. TV Brechten 26 604:657 0−53 18:34
12. TV Korschenbroich 26 572:631 0−59 14:38
13. Schalksmühler TV 26 547:625 0−78 11:41
14. HC TuRa Bergkamen 26 553:649 0−96 08:44
Staffel Süd
Pl. Verein Sp. Tore Diff. Pkt.
01. TuS Niederpleis 26 648:497 +151 46:60
02. Wermelskirchener TV 26 701:562 +139 43:90
03. HSG Römerwall 26 687:616 0+71 40:12
04. TuS Weibern 26 643:556 0+87 39:13
05. TV Jahn Wahn 26 585:516 0+69 30:22
06. TV Forsbach 26 653:617 0+36 28:24
07. Longericher SC 26 668:636 0+32 26:26
08. TVE Bad Münstereifel (N) 26 602:640 0−38 22:30
09. SV Urmitz 26 603:662 0−59 19:33
10. TV Vallendar 26 592:652 0−60 19:33
11. TSV Bayer Dormagen II 26 535:616 0−81 16:36
12. Fortuna Saarburg (N) 26 552:708 −156 16:36
13. VfL Gummersbach Junioren 26 506:587 0−81 10:42
14. HSG Irmenach-Kleinich 26 475:584 −109 10:42
Legende
Aufsteiger in die 2. Bundesliga
Absteiger in die Oberliga
(N) Aufsteiger aus der Oberliga
  • Der TuS Ferndorf, der TV Brechten, der TV Forsbach, der SV Urmitz und der TV Vallendar verzichteten auf ihre Regionalliga-Plätze.
  • Der TuS Spenge, der HSC Eintracht Recklinghausen und der TuS 97 Bielefeld-Jöllenbeck wechselten in die Regionalliga Nord.
  • Die beiden Staffeln wurden nach der Saison zusammengelegt.

Regionalliga Südwest

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Pl. Verein Sp. Tore Diff. Pkt.
01. TV Kirchzell 30 830:677 +153 54:60
02. TV Gelnhausen 30 728:669 0+59 41:19
03. TuSpo Obernburg 30 759:702 0+57 39:21
04. TSG Groß-Bieberau 30 714:664 0+50 36:24
05. SG Wallau/Massenheim II 30 762:718 0+44 35:25
06. TSG Ober-Eschbach 30 752:718 0+34 35:25
07. SG Werratal 92 30 741:734 00+7 35:25
08. TV Hüttenberg 30 725:675 0+50 33:27
09. HSG Haßloch-Hochdorf (N) 30 631:639 00−8 29:31
10. SF Budenheim 30 783:813 0−30 27:33
11. TV Groß-Umstadt 30 763:790 0−27 24:36
12. TBS Saarbrücken (N) 30 741:774 0−33 24:36
13. TuS Landstuhl 30 680:768 0−88 23:37
14. HSG Völklingen (N) 30 686:783 0−97 19:41
15. HG Saarlouis 30 673:747 0−74 16:44
16. SVH Kassel (N) 30 722:819 0−97 10:50
Legende
Aufsteiger in die 2. Bundesliga
(N) Aufsteiger aus der Oberliga
  • Die SG Werratal und die SVH Kassel wechselten in die neugegründete Regionalliga Mitte.

Regionalliga Süd

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Staffel Nord
Pl. Verein Sp. Tore Diff. Pkt.
01. HSG Kronau/Bad Schönborn (N) 26 732:552 +180 44:80
02. TSG Oßweil 26 657:523 +134 44:80
03. HSC Bad Neustadt 26 656:555 +101 40:12
04. HSV Hockenheim 26 602:507 0+95 35:17
05. TV Hemsbach 26 640:572 0+68 34:18
06. SV Fellbach (N) 26 611:549 0+62 29:23
07. TSB Horkheim 26 656:512 +144 27:25
08. LHV Hoyerswerda 26 581:604 0−23 24:28
09. SKV Oberstenfeld 26 566:594 0−28 24:28
10. TV Oppenweiler 26 617:631 0−14 21:31
11. HSG Freiberg (N) 26 537:678 −141 18:34
12. TSV 1846 Lohr 26 609:656 0−47 13:39
13. SG LVB Leipzig 26 554:642 0−88 10:42
14. Zwickauer HC Grubenlampe 26 486:829 −343 01:51
Staffel Süd
Pl. Verein Sp. Tore Diff. Pkt.
01. HSG Konstanz 26 726:608 +118 40:12
02. TSV Deizisau 26 629:611 0+18 37:15
03. TG Landshut 26 673:605 0+68 35:17
04. SG TB Roding/Post Regensburg 26 670:584 0+86 34:18
05. TSV Langenau 26 550:537 0+13 34:18
06. TSV Ottobeuren (N) 26 617:573 0+44 32:20
07. TV Weilstetten 26 608:595 0+13 28:24
08. TuS Durmersheim 26 549:566 0−17 28:24
09. TSV Bad Saulgau 26 622:586 0+36 26:26
10. TSV Trudering 26 516:554 0−38 18:34
11. SG Köndringen/Teningen 26 537:592 0−55 18:34
12. TuS Fürstenfeldbruck 26 523:635 −112 14:38
13. TuS Schutterwald II 26 508:580 0−72 13:39
14. HSG Singen/Gottmadingen (N) 26 604:706 −102 07:45
Legende
Aufsteiger in die 2. Bundesliga
Absteiger in die Oberliga
(A) Absteiger aus der 2. Bundesliga
(N) Aufsteiger aus der Oberliga
  • Die SG Roding/Post Regensburg verzichtete auf den Regionalliga-Platz.
  • Der HSC Bad Neustadt und der LHV Hoyerswerda wechselten in die neugegründete Regionalliga Mitte.
  • Der TSV Langenau schloss sich mit dem TSV Elchingen zur HSG Langenau/Elchingen zusammen.
  • Die beiden Staffeln wurden nach der Saison zusammengelegt.
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