Kollagen-Typ 20α1
Protein in Homo sapiens
Kollagen Typ XX, alpha 1 ist ein fibrillenassoziiertes Kollagen, das vom Gen COL20A1 codiert wird. Es bildet Homotrimere, die wiederum Kollagenfibrillen vom Typ XX formen.
| Kollagen Typ XX, alpha 1 | ||
|---|---|---|
| ||
| Bändermodell von Kollagen Typ XX, alpha 1 nach PDB 2DKM | ||
| Andere Namen |
| |
| Eigenschaften des menschlichen Proteins | ||
| Masse/Länge Primärstruktur | 1.284 Aminosäuren, 135.830 Da | |
| Isoformen | 3 | |
| Bezeichner | ||
| Gen-Namen | COL20A1 ; BA261N11.4; KIAA1510 | |
| Externe IDs | ||
| Vorkommen | ||
| Homologie-Familie | Hovergen | |
| Übergeordnetes Taxon | Euteleostomi | |
| Orthologe | ||
| Mensch | Hausmaus | |
| Entrez | 57642 | 73368 |
| Ensembl | ENSG00000101203 | ENSMUSG00000016356 |
| UniProt | Q9P218 | Q923P0 |
| Refseq (mRNA) | NM_020882.2 | NM_028518.1 |
| Refseq (Protein) | NP_065933.2 | NP_082794.1 |
| Genlocus | Chr 20: 63.29 – 63.33 Mb | Chr 2: 180.98 – 181.02 Mb |
| PubMed-Suche | 57642 | 73368
|
Eigenschaften
BearbeitenKollagen Typ XX, alpha 1 befindet sich meistens in der Epithelschicht der Hornhaut, der embryonalen Haut, dem Schwertfortsatz und in der Sehne.[1] Das Gen COL20A1 beeinflusst den Prozess des Zartmachens von Broilerfleisch.[2] Möglicherweise scheint COL20A1 ein Onkogen zu sein.[3]
Weblinks
BearbeitenEinzelnachweise
Bearbeiten- ↑ M. Koch, J. E. Foley, R. Hahn, P. Zhou, R. E. Burgeson, D. R. Gerecke, M. K. Gordon: alpha 1(Xx) collagen, a new member of the collagen subfamily, fibril-associated collagens with interrupted triple helices. In: J Biol Chem. 276. Jahrgang, Nr. 25, 22. Juni 2011, S. 23120–23126, doi:10.1074/jbc.M009912200, PMID 11274142.
- ↑ K. Piórkowska, K. Żukowski, J. Nowak, K. Połtowicz, K. Ropka-Molik, A. Gurgul: Genome-wide RNA-Seq analysis of breast muscles of two broiler chicken groups differing in shear force. In: Anim Genet. 47. Jahrgang, Nr. 1, Februar 2016, S. 68–80, doi:10.1111/age.12388, PMID 26592359.
- ↑ Chi-Cheng Huang, Shih-Hsin Tu, Heng-Hui Lien, Jaan-Yeh Jeng, Ching-Shui Huang, Chi-Jung Huang, Liang-Chuan Lai, Eric Y. Chuang: Concurrent gene signatures for han chinese breast cancers. In: PLoS One. 8. Jahrgang, Nr. 10, 3. Oktober 2013, doi:10.1371/journal.pone.0076421, PMID 24098497, PMC 3789693 (freier Volltext).