Komigrationsstandard

Als Komigrationsstandard oder Comigrationsstandard (umgangssprachlich auch Größenmarker, Größenleiter) bezeichnet man in der Biochemie und Molekularbiologie eine Probe bekannter Zusammensetzung, die in gelelektrophoretischen oder gelpermeationschromatographischen Auftrennungsverfahren eingesetzt wird, um einen Größenvergleich der Moleküle in Proben unbekannter Zusammensetzung zu ermöglichen. Dabei wird die Migration der enthaltenen Substanzen, beispielsweise Proteine oder DNA, in der Probe bekannter Zusammensetzung (Protein- oder DNA-Leiter) mit der Migration der Probe unbekannter Zusammensetzung verglichen. Eine gleiche Migrationsweite im Gel deutet dabei auf gleiche elektrophoretische Laufeigenschaften hin. Die gleichen Laufeigenschaften können mit Gelelektrophoresen, die einen direkten Zusammenhang zwischen der elektrophoretischen Mobilität und der molaren Masse aufweisen (z. B. Proteine per SDS-PAGE, DNA und RNA per Agarose-Gelelektrophorese), zur Bestimmung der Molmasse der in der Probe enthaltenen Moleküle verwendet werden.

DNA-Banden unter UV-Licht: Links ist der Komigrationsstandard aufgetragen, der als „Leiter“ erscheint

DNA-Marker

→ Hauptartikel: DNA-Leiter

DNA-Marker werden in der Agarose-Gelelektrophorese und der Polyacrylamid-Gelelektrophorese verwendet. Einer der früheren DNA-Marker war die DNA des Bakteriophagen λ, die mit dem Restriktionsenzym Hind III geschnitten wurde. Ein weiterer DNA-Marker war die mit HaeIII geschnittene DNA aus dem Bakteriophagen X174. Dabei waren die Größen der Fragmente in unregelmäßigen Abständen zueinander. Durch Ligation von Fragmenten von 100 Basenpaaren Länge kann eine DNA-Leiter mit ebendiesen Abständen erzeugt werden. Es wurden auch längere DNA-Sequenzen mit regelmäßigen Restriktionsschnittstellen per Polymerasekettenreaktion (PCR) erzeugt und anschließend mit der Restriktionsendonuklease SmaI teilweise geschnitten. Weiterhin wurden ausschließlich PCR-basierte Methoden zur Erzeugung von DNA-Leitern entwickelt.

Proteinmarker

Proteinmarker in der linken Spur. Dicke Banden von oben nach unten: 66, 45, 35, 24, 18 und 9 kDa. In den übrigen Spuren sind gereinigte Hefeproteine aufgetrennt.

→ Hauptartikel: „Molmassenbestimmung“ im Artikel SDS-PAGE

Typische Proteine in Proteinmarkern

Protein	Molmasse in einer SDS-PAGE (kDa)
Beta-Galactosidase	120
Phosphorylase B	94
Bovines Serumalbumin (BSA)	67
Ovalbumin	42,8
Truthahn-Albumin	40
Carboanhydrase	30
Soja-Trypsininhibitor	20,1
α-Lactalbumin	14,4
Lysozym	14

Literatur

• Friedrich Lottspeich, Joachim W. Engels (Hrsg.): Bioanalytik. 2. Aufl., Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2006, ISBN 978-3827415202.
• Hubert Rehm, Thomas Letzel: Der Experimentator: Proteinbiochemie / Proteomics. 6. Auflage, Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2009. ISBN 978-3-8274-2312-2.
• Cornel Mülhardt: Der Experimentator: Molekularbiologie/Genomics. Sechste Auflage. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2008. ISBN 3-8274-2036-9.