Bathyarchaeota

Bathyarchaeota
Systematik
Klassifikation:	Lebewesen
Domäne:	Archaeen (Archaea)
Reich:	Proteoarchaeota
Überabteilung:	TACK-Superphylum
Abteilung:	Bathyarchaeota
Wissenschaftlicher Name
	Bathyarchaeota
	Meng et al. 2014

„Bathyarchaeota“ ist ein vorgeschlagenes Kandidatenphylum der Archaeen. Obwohl es bisher nicht möglich war, Vertreter dieser Gruppe zu kultivieren, haben Metagenomanalysen ergeben, dass es sich um weit verbreitete Organismen handelt, die in nährstoffarmen Sedimenten des Meeresbodens reichlich vorkommen. Genetische Analysen haben ergeben, dass zumindest einige Linien der „Bathyarchaeota“ einen Stoffwechselweg der Homoacetogenese gehen, was bis dato ausschließlich bei Bakterien beobachtet wurde.^[1]

Das Phylum „Bathyarchaeota“ ist per Vorschlag ein nachträglich hinzugekommener Teil des „TACK-Superphylums“, so dass sein Anfangsbuchstabe ‚B‘ nicht in die Abkürzung (‚TACK‘) einging.

In neueren Taxonomien fungiert die Klade der Bathyarchaeen als Klasse Bathyarchaeia.^[2]

Beschreibung

Die „Bathyarchaeota“ sind anaerob und scheinen eine Schlüsselrolle im globalen Kohlenstoffkreislauf in terrestrischen und marinen anoxischen Sedimenten zu spielen. Einige „Bathyarchaeota“ sind in der Lage, den archaealen Wood-Ljungdahl-Weg zu gehen, was auf eine Fähigkeit zur CO₂-Fixierung durch Acetogenese hindeutet (zuvor nur bei Bakterien bekannt). Von Bedeutung ist, dass einige „Bathyarchaeota“ Methanbildner sein könnten, d. h. sie sind anscheinend in der Lage, Methan aus Methanol, Methylsulfiden (Dimethylsulfid etc.) und methylierten Amine zu produzieren.^[3]

Systematik

Die alten/veralteten Bezeichnungen weisen auf die frühere Zuordnung zum Phylum Crenarchaeota hin. Systematik der „Korarchaeia“ gemäß LPSN^[2] sowie Genome Taxonomy Database (GTDB)^[4] und National Center for Biotechnology Information (NCBI):^[5]

Superphylum „TACK“

Phylum Thermoproteota Garrity & Holt 2021
Synonym „Candidatus Bathyarchaeota“ Meng et al. 2014

Phylum „Candidatus Bathyarchaeota“ Meng et al. 2014

Klasse „Candidatus Bathyarchaeia“ McGonigle et al. 2019
Synonym Terrestrical Miscellaneous Crenarchaeotal group, Miscellaneous Crenarchaeotal group, MCG, auch I.3 (veraltet)

Ordnung „Candidatus Baizomonadales“ Hou et al. 2023

Familie „Candidatus Baizostellaceae“ Hou et al. 2023

Gattung „[Baizosediminiarchaeum]“ (formal ergänzt)

Spezies „Ca. Baizosediminiarchaeum ligniniphilus“ Yu et al. 2023

Ordnung „Candidatus Bathyarchaeales“ Khomyakova et al. 2023

Familie „Candidatus Bathyarchaeaceae“ Khomyakova et al. 2023

Gattung „Candidatus Bathyarchaeum“ Khomyakova et al. 2023

Spezies „Ca. Bathyarchaeum tardum“ Khomyakova et al. 2023

Referenzstamm: M17CTs alias M17C oder INSDC:CP122380

Gattung BA1 (GTDB)

Spezies BA1 sp001399805 (GTDB)
Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon BA1 (NCBI)

Gattung BA2 (GTDB)

Spezies BA2 sp001399795 (GTDB)
Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon BA2 (NCBI)

Familie „Bathycorpusculaceae“ Loh & Brune 2023
Synonym UBA233 (GTDB) – Gattung Termiticorpusculum syn. mit Bathycorpusculum

Gattung „Bathycorpusculum“ Loh & Brune 2023
Synonym PALSA-86 (NCBI, offenbar verschrieben für PALSA-986; siehe enthaltene Spezies)

Synonym [Hafrusarcha] (formal ergänzt nach Pallen et al. 2022, NCBI)

Synonym „Ca. Termiticorpusculum“ Loh et al. 2021^{[A. 1]}

Synonym „Ca. Termitimicrobium“ Loh et al. 2021 (NCBI, GTDB)^{[A. 1]}

Spezies „Ca. Bathycorpusculum acetigenerans“ Loh & Brune 2023
Synonym „Ca. Hafrusarcha ugapana“ Pallen et al. 2022 (NCBI)

Synonym PALSA-986 sp009781675 (NCBI)

Synonym Termiticorpusculum sp009781675 (GTDB)

Referenzstamm: Emb289P1_bin127 alias Emb289P1bin127 (NCBI, GTDB)

Spezies „Bathycorpusculum acidaminoxidans“ oder „Ca. Bathycorpusculum acidaminoxidans“ Loh & Brune 2023
Synonym „Ca. Hafrusarcha ecaria“ Pallen et al. 2022 (NCBI)

Synonym PALSA-986 sp009787585 (NCBI)

Synonym Termiticorpusculum sp009787585

Referenzstamm: Co191P4_bin18 (NCBI), Co191P4_bin18TS (LPSN), Co191P3bin4 (GTDB)

Spezies „Ca. Bathycorpusculum fermentans“ Loh & Brune 2023
Synonym „Ca. Hafrusarcha emabaria“ Pallen et al. 2022 (NCBI)

PALSA-986 sp009787175 (NCBI)

Synonym Termiticorpusculum sp009787175 (GTDB)

Referenzstamm: Nc150P4bin1 (GTDB)

Spezies „Ca. Bathycorpusculum grumuli“ Loh & Brune 2023
Synonym „Ca. Hafrusarcha otegia“ Pallen et al. 2022 (NCBI)

PALSA-986 sp009776805 (NCBI)

Termiticorpusculum sp009776805 (GTDB)

Referenzstamm: Th196P4_bin19 alias Th196P4bin19 (NCBI, GTDB)

Spezies „Ca. Bathycorpusculum hydrogenotrophicum“ Loh & Brune 2023
Synonym „Ca. Hafrusarcha upamia“ Pallen et al. 2022 (NCBI)

PALSA-986 sp009783705 (NCBI)

Termiticorpusculum sp009783705 (GTDB)

Referenzstamm: Lab288P3_bin169 alias Lab288P3bin169 (NCBI, GTDB)

Spezies „Ca. Bathycorpusculum soli“ Loh & Brune 2023
Synonym PALSA-986 sp009783705 (NCBI)

Synonym Termiticorpusculum sp009783705 (GTDB)

Referenzstamm: Pmx449_bin19 (NCBI), Lab288P3bin169 (GTDB)

Spezies „Ca. Bathycorpusculum termitum“ Loh & Brune 2023

Referenzstamm: Cus372_bin2 (NCBI)

Spezies „Ca. Bathycorpusculum terrae“ Loh & Brune 2023
Synonym „Ca. Hafrusarcha icagaria“ Pallen et al. 2022

Synonym PALSA-986 sp009779045 (NCBI)

Synonym Termiticorpusculum sp009779045 (GTDB)

Referenzstamm: Lab288P3_bin115 (NCBI), Lab288P4bin25 (GTDB)

Gattung SG8-32-3 (früher miscellaneous Crenarchaeota group-1, MCG-1)

Spezies SG8-32-3 sp001273335 (GTDB)
Synonym miscellaneous Crenarchaeota group-1 archaeon SG8-32-3 (NCNI)
Spezies miscellaneous Crenarchaeota group-1 archaeon SG8-32-1 (NCBI)

Gattung AD8-1 (früher miscellaneous Crenarchaeota group-6, MCG-6)

Spezies AD8-1 sp001273385 (GTDB)
Synonym miscellaneous Crenarchaeota group-6 archaeon AD8-1 (NCBI)

Ordnung „Candidatus Hecatellales“ Adam et al. 2022

Familie „Candidatus Hecatellaceae“ Adam et al. 2022

Gattung „Candidatus Hecatella“ Adam et al. 2022

Spezies „Ca. Hecatella orcuttiae“ Adam et al. 2022

Referenzstamm: JdFR-11 (NCBI, GTDB)

Gattung EX4484-218 (GTDB)

Spezies EX4484-218 sp002254975 (GTDB)
Synonym Ca. Hecatellales archaeon ex4484_218 (NCBI)

Synonym Ca. Candidatus Bathyarchaeota archaeon ex4484_218 (NCBI)

Gattung B25 (GTDB)

Spezies B25 sp003662515 (GTDB)
Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon B25 (NCBI)^{[A. 2]}

Ordnung B24 (GTDB)

Familie B24 (GTDB)

Gattung B24 (GTDB)

Spezies B24 sp001593865 (GTDB)
Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon B24 (NCBI)^{[A. 2]}

Ordnung TCS64 (GTDB)

Familie B23 (GTDB)

Gattung B23 (GTDB)

Spezies B23 sp001593875 (GTDB)
Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon B23 (NCBI)

Mitglieder der Bathyarchaeen ohne nähere Zuordnung:

Klade: miscellaneous Crenarchaeota group-15 (MCG-15)

Spezies: miscellaneous Crenarchaeota group-15 archaeon DG-45 (NCBI)

Anmerkungen

↑ ^a ^b ein Synonym gemäß NCBI; in der LPSN aber eine nicht näher zugeordnete Gattung der Bathyarchaeia
↑ ^a ^b Spezies Ca. Hecatellales archaeon B24 (syn. Ca. Bathyarchaeota archaeon B25) - offenbar Fehleintrag bei NCBI

Einzelnachweise

↑ Y. He, M. Li, V. Perumal, X. Feng, J. Fang, J. Xie, S. M. Sievert, F. Wang: Genomic and enzymatic evidence for acetogenesis among multiple lineages of the archaeal phylum Bathyarchaeota widespread in marine sediments, in: Nature Microbiology, Band 1, Nr. 16035, 4. April 2016, doi:10.1038/nmicrobiol.2016.35
↑ ^a ^b LPSN: Phylum "Candidatus Bathyarchaeota", Class "Candidatus Bathyarchaeia".
↑ Cindy J. Castelle, Jillian F. Banfield: Major New Microbial Groups Expand Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life. In: Cell Perspective, Band 172, Nr. 6, S. 1181–1197, 8. März 2018; doi:10.1016/j.cell.2018.02.016 (englisch).
↑ GTDB: Bathyarchaeia
↑ NCBI: Candidatus Bathyarchaeota (tree) und Bathyarchaeota Meng et al. 2014 (phylum; alias MCG, Terrestrial Miscellaneous Crenarchaeotic Group); graphisch: Candidatus Bathyarchaeota, auf: Lifemap, NCBI Version.

[corpusculum"-6] Synonym gemäß NCBI; in der LPSN aber eine nicht näher zugeordnete Gattung der Bathyarchaeia

[B25B25-7] Spezies Ca. Hecatellales archaeon B24 (syn. Ca. Bathyarchaeota archaeon B25) - offenbar Fehleintrag bei NCBI

[1] Y. He, M. Li, V. Perumal, X. Feng, J. Fang, J. Xie, S. M. Sievert, F. Wang: Genomic and enzymatic evidence for acetogenesis among multiple lineages of the archaeal phylum Bathyarchaeota widespread in marine sediments, in: Nature Microbiology, Band 1, Nr. 16035, 4. April 2016, doi:10.1038/nmicrobiol.2016.35

[LPSN-2] LPSN: Phylum "Candidatus Bathyarchaeota", Class "Candidatus Bathyarchaeia".

[Castelle2018-3] Cindy J. Castelle, Jillian F. Banfield: Major New Microbial Groups Expand Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life. In: Cell Perspective, Band 172, Nr. 6, S. 1181–1197, 8. März 2018; doi:10.1016/j.cell.2018.02.016 (englisch).

[GTDB-4] GTDB: Bathyarchaeia

[NCBI_Bathy-5] NCBI: Candidatus Bathyarchaeota (tree) und Bathyarchaeota Meng et al. 2014 (phylum; alias MCG, Terrestrial Miscellaneous Crenarchaeotic Group); graphisch: Candidatus Bathyarchaeota, auf: Lifemap, NCBI Version.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[A. 1]

[A. 2]