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Molekulare Epidemiologie

Die molekularen Epidemiologie bzw. molekulare Surveillance ist der Bereich der Epidemiologie, bei dem Erkenntnisse aus dem molekularen Aufbau von Pathogenen gewonnen werden, z. B. aus der DNA-Sequenz oder der Aminosäuresequenz. Die im Rahmen der molekularen Untersuchung gewonnenen Erkenntnisse dienen unter anderem der Überwachung epidemischer Krankheitserreger.

Eigenschaften

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Die molekulare Epidemiologie verwendet sequenzbasierte Daten oder andere Typisierungsdaten eines oder mehrerer Biomarker zur Bestätigung oder zum Ausschluss von Epidemien,[1] zur Ermittlung der Transmission und der Infektionswege, der Verbreitung, der Replikation und der Diversität von Pathogenen.[2] Fehlerquellen der molekularen Epidemiologie sind z. B. eine unvollständige Datenerfassung.[3] Teilweise können Erkenntnisse aus der molekularen Epidemiologie auch in eine Änderung von Handlungsanweisungen münden.[4]

Projekte zur Koordinierung von Erkenntnissen und Methoden sind z. B. STROBE und STROME-ID.[2]

Methoden

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Neben der DNA-Sequenzierung[5][6] und anderen Genotypisierungsmethoden[7] wird unter anderem auch die RNA-Seq[8] und die Proteinsequenzierung verwendet.[1]

Geschichte

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Die Bezeichnung ‚molekulare Epidemiologie‘ wurde 1973 durch E. D. Kilbourne geprägt und 1993 präzisiert.[9][10]

Literatur

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  • M. T. Smith, P. Hainaut, F. Perera, P. A. Schulte, P. Boffetta, S. J. Chanock, N. Rothman: Future perspectives on molecular epidemiology. In: IARC scientific publications. Nummer 163, 2011, S. 493–500, ISSN 0300-5038. PMID 22997879.
  • M. García-Closas, R. Vermeulen, D. Cox, Q. Lan, N. E. Caporaso, N. Rothman: Population-based study designs in molecular epidemiology. In: IARC scientific publications. Nummer 163, 2011, S. 241–259, ISSN 0300-5038. PMID 22997866.

Einzelnachweise

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  1. ↑ a b R. Ranjbar, A. Karami, S. Farshad, G. M. Giammanco, C. Mammina: Typing methods used in the molecular epidemiology of microbial pathogens: a how-to guide. In: The new microbiologica. Band 37, Nummer 1, Januar 2014, S. 1–15, ISSN 1121-7138. PMID 24531166.
  2. ↑ a b N. Field, T. Cohen, M. J. Struelens, D. Palm, B. Cookson, J. R. Glynn, V. Gallo, M. Ramsay, P. Sonnenberg, D. Maccannell, A. Charlett, M. Egger, J. Green, P. Vineis, I. Abubakar: Strengthening the Reporting of Molecular Epidemiology for Infectious Diseases (STROME-ID): an extension of the STROBE statement. In: The Lancet Infectious Diseases. Band 14, Nummer 4, April 2014, S. 341–352, ISSN 1474-4457. doi:10.1016/S1473-3099(13)70324-4. PMID 24631223.
  3. ↑ M. Desai, J. Kubo, D. Esserman, M. B. Terry: The handling of missing data in molecular epidemiology studies. In: Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention. Band 20, Nummer 8, August 2011, S. 1571–1579, ISSN 1538-7755. doi:10.1158/1055-9965.EPI-10-1311. PMID 21750174.
  4. ↑ P. A. Schulte, N. Rothman, P. Hainaut, M. T. Smith, P. Boffetta, F. P. Perera: Molecular epidemiology: linking molecular scale insights to population impacts. In: IARC scientific publications. Nummer 163, 2011, S. 1–7, ISSN 0300-5038. PMID 22997853.
  5. ↑ J. A. Carriço, A. J. Sabat, A. W. Friedrich, M. Ramirez: Bioinformatics in bacterial molecular epidemiology and public health: databases, tools and the next-generation sequencing revolution. In: Eurosurveillance. Band 18, Nummer 4, 2013, S. 20382, ISSN 1560-7917. PMID 23369390.
  6. ↑ M. Pérez-Losada, P. Cabezas, E. Castro-Nallar, K. A. Crandall: Pathogen typing in the genomics era: MLST and the future of molecular epidemiology. In: Infection, Genetics and Evolution. Band 16, Juni 2013, S. 38–53, ISSN 1567-7257. doi:10.1016/j.meegid.2013.01.009. PMID 23357583.
  7. ↑ S. Baker, W. P. Hanage, K. E. Holt: Navigating the future of bacterial molecular epidemiology. In: Current Opinion in Microbiology. Band 13, Nummer 5, Oktober 2010, S. 640–645, ISSN 1879-0364. doi:10.1016/j.mib.2010.08.002. PMID 20846899. PMC 2963795 (freier Volltext).
  8. ↑ C. M. McHale, L. Zhang, R. Thomas, M. T. Smith: Analysis of the transcriptome in molecular epidemiology studies. In: Environmental and Molecular Mutagenesis. Band 54, Nummer 7, August 2013, S. 500–517, ISSN 1098-2280. doi:10.1002/em.21798. PMID 23907930.
  9. ↑ E. D. Kilbourne: The molecular epidemiology of influenza. In: The Journal of Infectious Diseases. Band 127, Nummer 4, April 1973, S. 478–487, ISSN 0022-1899. PMID 4121053.
  10. ↑ Schulte, Paul A.; Perera, Frederica P.: Molecular Epidemiology: Principles and Practice. Academic Press, 1993. ISBN 0-12-632346-1. S. 588.
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