mzData

offenes XML basiertes Dateiformat in der Massenspektrometrie

mzData ist ein offenes XML basiertes Dateiformat in der Massenspektrometrie. Ziel war es Experimente, die mit Geräten von unterschiedlichen Herstellern aufgenommen wurden, in einem gemeinsamen Format abzubilden. Hierfür wurde auf ein externes kontrolliertes Vokabular zurückgegriffen.[2] Es ist dadurch etwas flexibler, um auf Veränderungen im apparativen und wissenschaftlichen Bereich zu reagieren als beispielsweise das sehr strikt schematisierte mzXML, verkompliziert jedoch die Implementation. Letztendlich wurde das Format durch mzML abgelöst, das die beiden konkurrierenden Standards mzXML und mzData harmonisiert.[3]

mzData
Dateiendung: .mzData
Entwickelt von: Proteomics Standards Initiative
Aktuelle Version 1.05[1]
(1. August 2006)
Erweitert zu: mzML
www.psidev.info


Einzelnachweise

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  1. mzData 1.05 Documents. HUPO Proteomics Standards Initiative, archiviert vom Original (nicht mehr online verfügbar); abgerufen am 21. Mai 2021.
  2. Sandra Orchard, Henning Hermjakob, Chris F. Taylor, Frank Potthast, Phil Jones, Weimin Zhu, Randall K. Julian Jr, Rolf Apweiler: Second Proteomics Standards Initiative Spring Workshop. In: Expert Review of Proteomics. Band 2, Nr. 3, 2005, ISSN 1478-9450, S. 287–289, doi:10.1586/14789450.2.3.287.
  3. Eric Deutsch: mzML: A single, unifying data format for mass spectrometer output. In: PROTEOMICS. Band 8, Nr. 14, 2008, ISSN 1615-9861, S. 2776–2777, doi:10.1002/pmic.200890049.