NotI
Protein
Das Enzym Not I ist ein Restriktionsenzym vom Typ II, eine Endonuklease, die DNA an einer spezifischen Stelle schneidet. Das Enzym wurde aus dem Bakterium Nocardia otitidis-cavarium isoliert. Es besitzt eine sequenzspezifische Erkennungsstelle auf der DNA, an der es spezifisch binden und die DNA an dieser Stelle schneiden kann. Das zugehörige Gen wurde sequenziert und kloniert.
| notI (Nocardia otitidiscaviarum) | ||
|---|---|---|
| Masse/Länge Primärstruktur | 383 Aminosäuren | |
| Sekundär- bis Quartärstruktur | Homodimer | |
| Bezeichner | ||
| Gen-Name(n) | notI (Rebase) | |
| Externe IDs | ||
| Enzymklassifikation | ||
| EC, Kategorie | 3.1.21.4, Restriktionsenzym | |
| Reaktionsart | Hydrolyse | |
| Substrat | DNA | |
| Produkte | Zweisträngige DNA-Fragmente mit terminalen 5'-Phosphatgruppen | |
| Erkennungssequenz | Restriktionsschnitt |
|---|---|
5'-GCGGCCGC-3' 3'-CGCCGGCG-5' |
5'-GC GGCCGC-3' 3'-CGCCGG CG-5' |
Bei der Durchtrennung der DNA entstehen einzelsträngige Überhänge, die aufgrund ihrer Affinität zu komplementären Sequenzen als sticky ends bezeichnet werden. Im Experiment kann das Enzym durch Hitze-Denaturierung, beispielsweise bei 65 °C für 20 Minuten, inaktiviert werden.
Literatur
Bearbeiten- Giedre Tamulaitiene & Virginijus Siksnys (2008): NotI is not boring. In: Structure. Bd. 16, Nr. 4, S. 497–498. PMID 18400171