Senecavirus

Die Gattung Senecavirus umfasst derzeit mit Senevacirus A nur eine Spezies (Art) eines unbehüllten Virus aus der Familie Picornaviridae, und in dieser das für die Gattung namensgebende Seneca-Valley-Virus (SVV) alias Senecavirus A1. Dieses Virus ist das bislang einzige bekannte apathogene Picornavirus (Mitglied der Picornaviridae). In seiner natürlichen Form ist es in der Lage, spezifische Tumorzellen von einigen Hirntumor-Arten zu zerstören; damit besitzt es die Eigenschaft eines onkolytischen Virus.

Senecavirus
Senecavirus
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Riboviria Reich: Orthornavirae Phylum: Pisuviricota Klasse: Pisoniviricetes Ordnung: Picornavirales Familie: Picornaviridae Unterfamilie: Caphthovirinae Gattung: Senecavirus
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA linear Baltimore: Gruppe 4 Symmetrie: ikosaedrisch Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Senecavirus
Links
ICTV Taxon History: 201902060 NCBI Taxonomy: 586425 NCBI Reference: NC_011349.1 ViralZone (Expasy, SIB): 697

Das SVV wurde im Jahr 2002 zufällig in einem Unternehmen für Gentherapie in Gaithersburg (Maryland) isoliert. Bei der Suche nach Kontaminationen von Zellkulturen wurden aus dem Kulturmedium einer PER.C6-Zelllinie (transformierte, fötale Retinoblastom-Zellen) mehrere porzine Picornaviren isoliert, von denen eines sich als neues Virus herausstellte, das schließlich 2005 als neu charakterisiertes Virus veröffentlicht wurde. Da sich die Firma in Gaithersburg im sogenannten Seneca Valley (Gebiet des Little Seneca Lakes und des Seneca Creeks) befindet, wurde das Virus danach benannt. Nach seiner Identifizierung konnte es in verschiedenen Hausschweinen von Schweinefarmen in den USA entdeckt werden.

Genom und Struktur

Genomkarte der Gattung Seneca­virus

Das Genom besteht aus einer linearen einzelsträngigen RNA mit positiver Polarität und hat bei dem bisher einzigen bekannten Serotyp SVV-001 eine Länge von 7310 nt. Die nicht codierende Region am 5'-Ende ist 666 nt lang und beinhaltet eine IRES vom Typ IV, die eine Ähnlichkeit zu den IRES-Strukturen der Pestiviren aufweist. Am 3'-Ende befindet sich ebenfalls eine 71 nt lange nicht codierende Region, die mit ihrer möglichen Faltungsstruktur typisch ist zur Bildung eines Kissing-Loops, um beide RNA-Enden während der RNA-Replikation als Rolling-Circle zusammenzuführen Die größte Sequenzähnlichkeit besteht zu Mitgliedern der Gattung Cardiovirus und Aphthovirus. Im Vergleich zu den Cardioviren und den Erboviren jedoch fehlen dem SVV zwei für die katalytische Funktion notwendigen Aminsosäurepositionen, die üblicherweise die Funktion als Protease und Phosphorylase ermöglichen. Dies kann ein Grund für die fehlende Erkrankung im natürlichen Wirt sein.

Das 32,5 nm große unbehüllte Kapsid des SVV besteht aus den vier Kapsidproteinen VP1, VP2, VP3 und VP4 (VP für Virusprotein). Die äußeren Proteindomänen von VP1 und VP2 vermitteln sehr wahrscheinlich die Bindung an die Wirtszelle und damit den Zelltropismus des Virus.

Biologische Eigenschaften

Der natürliche Wirt des SVV sind wahrscheinlich Schweine, aus denen das Virus zwar isoliert werden kann, die aber gleichzeitig keine Symptome einer Erkrankung zeigen. Antikörper gegen das SVV konnten auch in weiteren landwirtschaftlichen Nutztieren gefunden werden, so bei Rindern und Schafen; bei Menschen findet man hingegen keine anti-SVV-Antikörper. In die Zellkultur, in der das Virus entdeckt wurde, scheint es wahrscheinlich durch fetales Kälber- oder -Ferkel-Serum gelangt zu sein, welches zur Kultivierung der Zellen verwendet worden war.

Das SVV besitzt neben dem natürlichen Zelltropismus im Wirtstier zusätzlich in der Zellkultur einen Tropismus für Neuroendokrine Tumorzellen wie dem Retinoblastom, Neuroblastom, Medulloblastom und dem Kleinzelligen Bronchialkarzinom. Diese in vitro infizierbaren Zellen werden während der Virusreplikation zerstört. Aus diesem Grunde gilt das SVV als ein möglicherweise in der Therapie dieser Tumore anwendbares onkolytisches Virus.

Systematik

• Genus Senecavirus

• Spezies Seneca-Valley-Virus (en. Senecavirus A, SeVV-A)

• Serotyp Seneca-Valley-Virus USA/SVV-001 (SVV-1)

Literatur

• A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (Hrsg.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012, ISBN 978-0-12-384684-6, S. 872f
• N. J. Knowles, P. L. Hallenbeck: A new picornavirus is most closely related to cardioviruses. EUROPIC 2005: XIIIth Meeting of the European Study Group on the Molecular Biology of Picornaviruses, Lunteren, Niederlande, 23.–29. Mai 2005, Abstract A14 (Erstbeschreibung)
• N. J. Knowles et al.: Epidemiology of Seneca Valley virus: Identification and characterization of isolates from pigs in the United States. EUROPIC 2005: European Study Group on the Molecular Biology of Picornaviruses XIIIth Meeting, Lunteren, Niederlande, Mai 2005 (pdf)
• S. Venkataraman et al.: Structure of Seneca Valley Virus-001: an oncolytic picornavirus representing a new genus. Structure (2008) 16(10): S. 1555–1561. PMID 18940610, PMC 2572565 (freier Volltext)
• L. M. Hales et al.: Complete genome sequence analysis of Seneca Valley virus-001, a novel oncolytic picornavirus. J. Gen. Virol. (2008) 89(Pt 5): S. 1265–1275. PMID 18420805
• S. Venkataraman et al.: Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of Seneca Valley virus-001, a new member of the Picornaviridae family. Acta Crystallogr. Sect F Struct. Biol. Cryst. Commun. (2008) 64(Pt 4): S. 293–296. PMID 18391430, PMC 2374260 (freier Volltext)