Bei Punktgleichheit in der Gruppenphase war die Tordifferenz für das Weiterkommen maßgebend, dann die Anzahl der erzielten Tore, danach die der auswärts erzielten Treffer. Sind auch diese gleich, entschied in der Gruppenphase das Los, in den K.-o.-Runden ein Elfmeterschießen. Lediglich im Finale folgte gegebenenfalls bei unentschiedenem Spielstand nach Hin- und Rückspiel vor dem Elfmeterschießen noch eine Verlängerung .
Das angegebene Datum bezieht sich jeweils auf die Ortszeit. Viele Spiele finden in Südamerika abends statt, was den frühen Morgenstunden des Folgetages in Mitteleuropa entspricht.
20. Februar 2007
CD El Nacional
1:2
Club América
Estadio Olímpico Atahualpa
Club Libertad
1:0
CA Banfield
Estadio Defensores del Chaco
27. Februar 2007
CA Banfield
4:1
CD El Nacional
Estadio Florencio Sola
1. März 2007
Club América
1:4
Club Libertad
Estadio Azteca
6. März 2007
CD El Nacional
1:1
Club Libertad
Estadio Olímpico Atahualpa
7. März 2007
Club América
4:0
CA Banfield
Estadio Azteca
21. März 2007
CA Banfield
3:1
Club América
Estadio Florencio Sola
22. März 2007
Club Libertad
1:0
CD El Nacional
Estadio Defensores del Chaco
3. April 2007
CD El Nacional
0:1
CA Banfield
Estadio Olímpico Atahualpa
11. April 2007
Club Libertad
1:2
Club América
Estadio Defensores del Chaco
18. April 2007
CA Banfield
0:1
Club Libertad
Estadio Florencio Sola
Club América
2:1
CD El Nacional
Estadio Azteca
14. Februar 2007
Audax Italiano
0:0
FC São Paulo
Estadio San Carlos de Apoquindo
20. Februar 2007
Alianza Lima
1:2
Club Necaxa
Estadio Alejandro Villanueva
28. Februar 2007
FC São Paulo
4:0
Alianza Lima
Estádio do Morumbi
Club Necaxa
2:0
Audax Italiano
Estadio Victoria
13. März 2007
Alianza Lima
1:3
Audax Italiano
Estadio Alejandro Villanueva
21. März 2007
Club Necaxa
2:1
FC São Paulo
Estadio Victoria
27. März 2007
Audax Italiano
1:0
Alianza Lima
Estadio Nacional de Chile
4. April 2007
FC São Paulo
3:0
Club Necaxa
Estádio do Morumbi
11. April 2007
Audax Italiano
2:1
Club Necaxa
Estadio Monumental (Santiago de Chile)
18. April 2007
Alianza Lima
0:1
FC São Paulo
Estadio Alejandro Villanueva
25. April 2007
FC São Paulo
2:2
Audax Italiano
Estádio do Morumbi
Club Necaxa
2:0
Alianza Lima
Estadio Victoria
13. Februar 2007
Cúcuta Deportivo
0:0
Deportes Tolima
Estadio General Santander
15. Februar 2007
Club Cerro Porteño
0:1
Grêmio Porto Alegre
Estadio General Pablo Rojas
27. Februar 2007
Grêmio Porto Alegre
0:0
Cúcuta Deportivo
Estádio Olímpico Monumental
7. März 2007
Deportes Tolima
1:0
Club Cerro Porteño
Estadio Manuel Murillo Toro
13. März 2007
Cúcuta Deportivo
1:1
Club Cerro Porteño
Estadio General Santander
15. März 2007
Deportes Tolima
1:0
Grêmio Porto Alegre
Estadio Manuel Murillo Toro
20. März 2007
Club Cerro Porteño
2:1
Cúcuta Deportivo
Estadio Antonio Oddone Sarubbi
27. März 2007
Grêmio Porto Alegre
1:0
Deportes Tolima
Estádio Olímpico Monumental
10. April 2007
Club Cerro Porteño
1:0
Deportes Tolima
Estadio Defensores del Chaco
11. April 2007
Cúcuta Deportivo
3:1
Grêmio Porto Alegre
Estadio General Santander
24. April 2007
Grêmio Porto Alegre
1:0
Club Cerro Porteño
Estádio Olímpico Monumental
Deportes Tolima
3:4
Cúcuta Deportivo
Estadio Manuel Murillo Toro
13. Februar 2007
CS Emelec
0:1
CA Vélez Sarsfield
Estadio George Capwell
21. Februar 2007
Nacional Montevideo
3:1
SC Internacional
El Parque Central
28. Februar 2007
CA Vélez Sarsfield
1:1
Nacional Montevideo
El Fortín
SC Internacional
3:0
CS Emelec
Estádio Beira-Rio
14. März 2007
CA Vélez Sarsfield
3:0
SC Internacional
El Fortín
22. März 2007
CS Emelec
1:0
Nacional Montevideo
Estadio George Capwell
28. März 2007
SC Internacional
0:0
CA Vélez Sarsfield
Estádio Beira-Rio
3. April 2007
Nacional Montevideo
3:1
CS Emelec
El Parque Central
10. April 2007
CS Emelec
1:2
SC Internacional
Estadio George Capwell
12. April 2007
Nacional Montevideo
2:0
CA Vélez Sarsfield
El Parque Central
19. April 2007
SC Internacional
1:0
Nacional Montevideo
Estádio Beira-Rio
CA Vélez Sarsfield
1:0
CS Emelec
El Fortín
14. Februar 2007
Real Potosí
2:2
Flamengo Rio de Janeiro
Estadio Victor Agustín Ugarte
15. Februar 2007
UA Maracaibo
2:4
Paraná Clube
Estadio José Encarnación Romero
21. Februar 2007
Paraná Clube
2:0
Real Potosí
Vila Capanema
Flamengo Rio de Janeiro
3:1
UA Maracaibo
Estádio do Maracanã
13. März 2007
UA Maracaibo
1:1
Real Potosí
Estadio José Encarnación Romero
14. März 2007
Paraná Clube
0:1
Flamengo Rio de Janeiro
Vila Capanema
20. März 2007
Real Potosí
2:2
UA Maracaibo
Estadio Victor Agustín Ugarte
21. März 2007
Flamengo Rio de Janeiro
1:0
Paraná Clube
Estádio do Maracanã
4. April 2007
UA Maracaibo
1:2
Flamengo Rio de Janeiro
Estadio José Encarnación Romero
10. April 2007
Real Potosí
3:1
Paraná Clube
Estadio Victor Agustín Ugarte
18. April 2007
Flamengo Rio de Janeiro
1:0
Real Potosí
Estádio do Maracanã
Paraná Clube
2:1
UA Maracaibo
Vila Capanema
22. Februar 2007
FC Caracas
1:0
Liga de Quito
Estadio Brígido Iriarte
CSD Colo-Colo
1:2
CA River Plate
Estadio Monumental (Santiago de Chile)
6. März 2007
Liga de Quito
3:1
CSD Colo-Colo
Estadio La Casa Blanca
8. März 2007
CA River Plate
0:1
FC Caracas
El Monumental
15. März 2007
Liga de Quito
1:1
CA River Plate
Estadio La Casa Blanca
20. März 2007
FC Caracas
0:4
CSD Colo-Colo
Estadio Brígido Iriarte
27. März 2007
CSD Colo-Colo
2:1
FC Caracas
Estadio Monumental (Santiago de Chile)
29. März 2007
CA River Plate
0:0
Liga de Quito
El Monumental
3. April 2007
CSD Colo-Colo
4:0
Liga de Quito
Estadio Monumental (Santiago de Chile)
5. April 2007
FC Caracas
3:1
CA River Plate
Estadio Brígido Iriarte
25. April 2007
CA River Plate
1:0
CSD Colo-Colo
El Monumental
Liga de Quito
3:1
FC Caracas
Estadio La Casa Blanca
14. Februar 2007
Club Bolívar
0:0
Boca Juniors
Estadio Hernando Siles
21. Februar 2007
CS Cienciano
1:2
Deportivo Toluca
Estadio Garcilaso de la Vega
27. Februar 2007
Deportivo Toluca
1:2
Club Bolívar
Estadio Nemesio Díez
1. März 2007
Boca Juniors
1:0
CS Cienciano
El Nuevo Gasómetro
8. März 2007
CS Cienciano
5:1
Club Bolívar
Estadio Garcilaso de la Vega
14. März 2007
Deportivo Toluca
2:0
Boca Juniors
Estadio Nemesio Díez
22. März 2007
Boca Juniors
3:0
Deportivo Toluca
El Fortín
28. März 2007
Club Bolívar
2:3
CS Cienciano
Estadio Hernando Siles
4. April 2007
CS Cienciano
3:0
Boca Juniors
Estadio Garcilaso de la Vega
12. April 2007
Club Bolívar
0:2
Deportivo Toluca
Estadio Hernando Siles
26. April 2007
Boca Juniors
7:0
Club Bolívar
El Fortín
Deportivo Toluca
3:0
CS Cienciano
Estadio Nemesio Díez
13. Februar 2007
Defensor Sporting
3:0
Gimnasia y Esgrima La Plata
Estadio Centenario
22. Februar 2007
Deportivo Pasto
1:2
FC Santos
Estadio Departamental Libertad
1. März 2007
FC Santos
1:0
Defensor Sporting
Estádio Urbano Caldeira
6. März 2007
Gimnasia y Esgrima La Plata
3:2
Deportivo Pasto
Estadio Ciudad de La Plata
14. März 2007
FC Santos
3:0
Gimnasia y Esgrima La Plata
Estádio Urbano Caldeira
15. März 2007
Deportivo Pasto
1:2
Defensor Sporting
Estadio Departamental Libertad
22. März 2007
Gimnasia y Esgrima La Plata
1:2
FC Santos
Estadio Ciudad de La Plata
29. März 2007
Defensor Sporting
3:0
Deportivo Pasto
Estadio Centenario
5. April 2007
Defensor Sporting
0:2
FC Santos
Estadio Centenario
Deportivo Pasto
0:2
Gimnasia y Esgrima La Plata
Estadio Departamental Libertad
19. April 2007
Gimnasia y Esgrima La Plata
3:0
Defensor Sporting
Estadio Ciudad de La Plata
FC Santos
3:0
Deportivo Pasto
Estádio Urbano Caldeira
Für das Achtelfinale qualifizierten sich der Erste und der Zweite jeder Gruppe.
Die Spiele wurden nicht ausgelost, sondern über eine Setzliste bestimmt. An die acht Gruppensieger wurden entsprechend ihrer Rangfolge die Startnummern 1 bis 8 vergeben, der beste Gruppensieger erhielt also die 1, der zweitbeste Gruppensieger die 2 usw. Die acht Gruppenzweiten erhielten die Startnummern 9 bis 16. Im Achtelfinale spielten dann 1 – 16, 2 – 15, 3 – 14 …, also der beste Gruppenerste gegen den schlechtesten Gruppenzweiten usw.
Es kam daher zu folgenden Partien. Die Hinspiele wurden am 2. Mai 2007 ausgetragen, die Rückspiele am 9. Mai 2007. Die jeweils erstgenannte Mannschaft hatte im Hinspiel Heimrecht, die jeweils andere im Rückspiel.
Mit den Partien im Achtelfinale wurde gleichzeitig auch der weitere Verlauf der K.-o.-Runden bis zum Finale festgelegt.
Die Hinspiele des Viertelfinals wurden am 15., 16. und 17. Mai 2007, die Rückspiele am 23. Mai 2007 ausgetragen.
Die Hinspiele der Halbfinals wurden am 30. Mai 2007, die Rückspiele am 6. Juni ausgetragen. Nach dem ursprünglichen Modus (Sieger S1 – Sieger S4 und Sieger S2 – Sieger S3) hätten der Santos FC gegen Cúcuta und Grêmio gegen die Boca Juniors antreten müssen. Da die CONMEBOL vermeiden wollte, dass wie im Vorjahr zwei Mannschaften aus einem Land das Finale erreichen, wurde der Santos FC ins zweite statt ins erste Halbfinale gesetzt.
Boca Juniors
Grêmio Porto Alegre
Mauricio Caranta – Claudio Morel , Hugo Ibarra , Daniel Díaz , Clemente Rodríguez , Pablo Ledesma , Juan Román Riquelme , Neri Cardozo (67. Jesús Dátolo ), Éver Banega (81. Sebastián Battaglia ), Martín Palermo , Rodrigo Palacio Cheftrainer: Miguel Ángel Russo
Sebastián Saja – William , Teco , Patrício , Diego Gavilán , Diego Souza , Tcheco (80. Douglas ), Sandro Goiano , Lúcio , Carlos Eduardo , Tuta (72. Lucas )Cheftrainer: Mano Menezes
1:0 Rodrigo Palacio (18.) 2:0 Juan Román Riquelme (73.) 3:0 Patrício (89., Eigentor)
Hugo Ibarra (13.), Éver Banega (34.), Juan Román Riquelme (53.), Neri Cardozo (64.)
Patrício (15.), Sandro Goiano (53.)
Sandro Goiano (58.)
Grêmio Porto Alegre
Boca Juniors
Sebastián Saja – William , Teco (35. Rolando Schiavi ), Patrício , Diego Gavilán , Diego Souza , Tcheco (46. Márcio Amoroso ), Lúcio , Carlos Eduardo , Tuta (70. Éverton ), Lucas Cheftrainer: Mano Menezes
Mauricio Caranta – Claudio Morel , Hugo Ibarra , Daniel Díaz , Clemente Rodríguez , Pablo Ledesma , Juan Román Riquelme , Neri Cardozo (59. Sebastián Battaglia ), Éver Banega (82. Sergio Órteman ), Martín Palermo , Rodrigo Palacio (87. Mauro Boselli )Cheftrainer: Miguel Ángel Russo
0:1 Juan Román Riquelme (68.) 0:2 Juan Román Riquelme (80.)
Diego Souza (50.), Lucas (70.), Rolando Schiavi (84.), Lúcio (88.)
Pablo Ledesma (74.)