Phytoen-Desaturase

Bakterielle Phytoen Desaturase
	Kristallografische Struktur der Phytoen Desaturase aus Pantoea ananatis.
	Vorhandene Strukturdaten: 4DGK
Masse/Länge Primärstruktur	501 Aminosäuren
Bezeichner
Gen-Name(n)	CRTI
Externe IDs	UniProt Q07356;
Enzymklassifikation
EC, Kategorie	1.3.99.31, Oxidoreduktase
Reaktionsart	Dehydrogenierung
Substrat	15-cis-Phytoen
Produkte	all-trans-z-Lycopin
Vorkommen
Homologie-Familie	Hovergen
Übergeordnetes Taxon	Bakterien

Pflanzliche Phytoen Desaturase
	Kristallografische Struktur der Phytoen Desaturase aus Reis.
	Vorhandene Strukturdaten: 5MOG
Masse/Länge Primärstruktur	491 Aminosäuren
Kofaktor	FAD
Bezeichner
Gen-Name(n)	PDS
Externe IDs	UniProt A2XDA1;
Enzymklassifikation
EC, Kategorie	1.3.5.5, Oxidoreduktase
Reaktionsart	Dehydrogenierung
Substrat	15-cis-Phytoen
Produkte	9,15,9'-tri-cis-ζ-Carotin
Vorkommen
Übergeordnetes Taxon	Pflanzen

Phytoen-Desaturasen sind an der Carotinoid-Biosynthese beteiligte Enzyme aus der Gruppe der Desaturasen. Sie katalysieren die Dehydrogenierung von 15-cis-Phytoen. Unterschieden wird zwischen bakteriellen und pilzliche Phytoen Desaturasen (CRTI) und pflanzlichen und cyanobakteriellen Phytoen Desaturasen (PDS). CRTI katalysiert die Umwandlung von Phytoen direkt zu all-trans-Lycopin.^[3] Die komplette Umwandlung in Pflanzen und Bakterien erfolgt über vier Enzyme (PDS, ζ-Carotin Isomerase, ζ-Carotin Desaturase, Cis-Trans Isomerase),^[4] von denen PDS den ersten Schritt zum ζ-Carotin katalysiert.^[5]

Biochemie

Die Umwandlung von Phytoen in Pflanzen und Cyanobakterien (links) im Vergleich zur Umwandlung in Bakterien und Pilzen (rechts).

Bei der Umwandlung von 15-cis-Phytoen in all-trans-Lycopin werden insgesamt vier neue Doppelbindungen ins Substrat-Molekül eingeführt.^[4] Die Oxidation des Phytoens erfolgt dabei unter Reduktion von FAD, welches sowohl in bakteriellen^[6] als auch in pflanzlichen^[1] Phytoen Desaturasen enthalten ist. Während CRTI den gesamten biochemischen Pfad zu Lycopin darstellt, erfolgt bei PDS lediglich die Katalyse zu 9,15,9'-tri-cis-ζ-Carotin. Dabei werden an Position 11 und 11' der symmetrischen Kohlenstoffkette zwei neue Doppelbindungen eingeführt und an Positionen 9 und 9' die Doppelbindungen von trans nach cis isomerisiert. Die bei dieser Reaktion entfernten Elektronen werden über FAD an Plastochinon abgeführt^[7] und über terminale Oxidasen letztlich zur Sauerstoff-Reduktion genutzt.

Verwendung

Einige Herbizide wie Norflurazon, Diflufenican und Picolinafen wirken durch Hemmung der PDS.^[8] Dabei blockiert das Herbizid die Bindestelle von Plastochinon innerhalb des Enzyms.^[1] Da das Ausschalten des PDS-Gens in Pflanzen ein Ausbleichen der Pflanze bewirkt,^[9] wurde dieser Effekt zur Präsentation von effizienter Genomeditierung mittels CRISPR/Cas9 genutzt.^[10]^[11]

Im Goldenen Reis wurde neben einer Phytoensynthase und Lycopincyclase aus der Narzisse das Gen einer bakteriellen Phytoen Desaturase in das Reisgenom integriert.^[12]

Einzelnachweise

↑ ^a ^b ^c Anton Brausemann, Sandra Gemmecker, Julian Koschmieder, Sandro Ghisla, Peter Beyer, Oliver Einsle: Structure of Phytoene Desaturase Provides Insights into Herbicide Binding and Reaction Mechanisms Involved in Carotene Desaturation. In: Structure. Band 25, Nr. 8, 2017, S. 1222–1232.E3, doi:10.1016/j.str.2017.06.002, PMID 28669634.
↑ Patrick Schaub, Qiuju Yu, Sandra Gemmecker, Pierre Poussin-Courmontagne, Justine Mailliot, Alastair G. McEwen, Sandro Ghisla, Salim Al-Babili, Jean Cavarelli, Peter Beyer: On the Structure and Function of the Phytoene Desaturase CRTI from Pantoea ananatis, a Membrane-Peripheral and FAD-Dependent Oxidase/Isomerase. In: PLoS One. Band 7, Nr. 6, 2012, S. e39550, doi:10.1371/journal.pone.0039550, PMID 22745782, PMC 3382138 (freier Volltext).
↑ P. D. Fraser, N. Misawa, H. Linden, S. Yamano, K. Kobayashi: Expression in Escherichia coli, purification, and reactivation of the recombinant Erwinia uredovora phytoene desaturase. In: The Journal of Biological Chemistry. Band 267, Nr. 28, 5. Oktober 1992, ISSN 0021-9258, S. 19891–19895, PMID 1400305.
↑ ^a ^b Alexander R. Moise, Salim Al-Babili, Eleanore T. Wurtzel: Mechanistic aspects of carotenoid biosynthesis. In: Chemical Reviews. Band 114, Nr. 1, 8. Januar 2014, ISSN 1520-6890, S. 164–193, doi:10.1021/cr400106y, PMID 24175570.
↑ P D Fraser, H Linden, G Sandmann: Purification and reactivation of recombinant Synechococcus phytoene desaturase from an overexpressing strain of Escherichia coli. In: Biochemical Journal. Band 291, Nr. 3, 1. Mai 1993, ISSN 0264-6021, S. 687–692, PMID 8489496.
↑ T. A. Dailey, H. A. Dailey: Identification of an FAD superfamily containing protoporphyrinogen oxidases, monoamine oxidases, and phytoene desaturase. Expression and characterization of phytoene desaturase of Myxococcus xanthus. In: The Journal of Biological Chemistry. Band 273, Nr. 22, 29. Mai 1998, ISSN 0021-9258, S. 13658–13662, PMID 9593705.
↑ S. R. Norris, T. R. Barrette, D. DellaPenna: Genetic dissection of carotenoid synthesis in arabidopsis defines plastoquinone as an essential component of phytoene desaturation. In: The Plant Cell. Band 7, Nr. 12, Dezember 1995, ISSN 1040-4651, S. 2139–2149, doi:10.1105/tpc.7.12.2139, PMID 8718624, PMC 161068 (freier Volltext).
↑ Thomas Seitz, Michael G. Hoffmann, Hansjörg Krähmer: Herbizide für die Landwirtschaft: Chemische Unkrautbekämpfung. In: ChiuZ. Band 37, Nr. 2, 2003, S. 118, doi:10.1002/ciuz.200300279.
↑ Genji Qin, Hongya Gu, Ligeng Ma, Yiben Peng, Xing Wang Deng: Disruption of phytoene desaturase gene results in albino and dwarf phenotypes in Arabidopsis by impairing chlorophyll, carotenoid, and gibberellin biosynthesis. In: Cell Research. Band 17, Nr. 5, 2007, ISSN 1748-7838, S. 471–482, doi:10.1038/cr.2007.40, PMID 17486124.
↑ Chikako Nishitani, Narumi Hirai, Sadao Komori, Masato Wada, Kazuma Okada: Efficient Genome Editing in Apple Using a CRISPR/Cas9 system. In: Scientific Reports. Band 6, 2016, ISSN 2045-2322, S. 31481, doi:10.1038/srep31481, PMID 27530958, PMC 4987624 (freier Volltext).
↑ Ikuko Nakajima, Yusuke Ban, Akifumi Azuma, Noriyuki Onoue, Takaya Moriguchi: CRISPR/Cas9-mediated targeted mutagenesis in grape. In: PloS One. Band 12, Nr. 5, 2017, ISSN 1932-6203, S. e0177966, doi:10.1371/journal.pone.0177966, PMID 28542349, PMC 5436839 (freier Volltext).
↑ Peter Schopfer: Pflanzenphysiologie. Elsevier, Spektrum Akademischer Verlag, München 2010, ISBN 978-3-8274-2351-1, S. 382–383.

[pmid28669634-1] Anton Brausemann, Sandra Gemmecker, Julian Koschmieder, Sandro Ghisla, Peter Beyer, Oliver Einsle: Structure of Phytoene Desaturase Provides Insights into Herbicide Binding and Reaction Mechanisms Involved in Carotene Desaturation. In: Structure. Band 25, Nr. 8, 2017, S. 1222–1232.E3, doi:10.1016/j.str.2017.06.002, PMID 28669634.

[pmid22745782-2] Patrick Schaub, Qiuju Yu, Sandra Gemmecker, Pierre Poussin-Courmontagne, Justine Mailliot, Alastair G. McEwen, Sandro Ghisla, Salim Al-Babili, Jean Cavarelli, Peter Beyer: On the Structure and Function of the Phytoene Desaturase CRTI from Pantoea ananatis, a Membrane-Peripheral and FAD-Dependent Oxidase/Isomerase. In: PLoS One. Band 7, Nr. 6, 2012, S. e39550, doi:10.1371/journal.pone.0039550, PMID 22745782, PMC 3382138 (freier Volltext).

[pmid1400305-3] P. D. Fraser, N. Misawa, H. Linden, S. Yamano, K. Kobayashi: Expression in Escherichia coli, purification, and reactivation of the recombinant Erwinia uredovora phytoene desaturase. In: The Journal of Biological Chemistry. Band 267, Nr. 28, 5. Oktober 1992, ISSN 0021-9258, S. 19891–19895, PMID 1400305.

[pmid24175570-4] Alexander R. Moise, Salim Al-Babili, Eleanore T. Wurtzel: Mechanistic aspects of carotenoid biosynthesis. In: Chemical Reviews. Band 114, Nr. 1, 8. Januar 2014, ISSN 1520-6890, S. 164–193, doi:10.1021/cr400106y, PMID 24175570.

[pmid8489496-5] P D Fraser, H Linden, G Sandmann: Purification and reactivation of recombinant Synechococcus phytoene desaturase from an overexpressing strain of Escherichia coli. In: Biochemical Journal. Band 291, Nr. 3, 1. Mai 1993, ISSN 0264-6021, S. 687–692, PMID 8489496.

[6] T. A. Dailey, H. A. Dailey: Identification of an FAD superfamily containing protoporphyrinogen oxidases, monoamine oxidases, and phytoene desaturase. Expression and characterization of phytoene desaturase of Myxococcus xanthus. In: The Journal of Biological Chemistry. Band 273, Nr. 22, 29. Mai 1998, ISSN 0021-9258, S. 13658–13662, PMID 9593705.

[7] S. R. Norris, T. R. Barrette, D. DellaPenna: Genetic dissection of carotenoid synthesis in arabidopsis defines plastoquinone as an essential component of phytoene desaturation. In: The Plant Cell. Band 7, Nr. 12, Dezember 1995, ISSN 1040-4651, S. 2139–2149, doi:10.1105/tpc.7.12.2139, PMID 8718624, PMC 161068 (freier Volltext).

[8] Thomas Seitz, Michael G. Hoffmann, Hansjörg Krähmer: Herbizide für die Landwirtschaft: Chemische Unkrautbekämpfung. In: ChiuZ. Band 37, Nr. 2, 2003, S. 118, doi:10.1002/ciuz.200300279.

[9] Genji Qin, Hongya Gu, Ligeng Ma, Yiben Peng, Xing Wang Deng: Disruption of phytoene desaturase gene results in albino and dwarf phenotypes in Arabidopsis by impairing chlorophyll, carotenoid, and gibberellin biosynthesis. In: Cell Research. Band 17, Nr. 5, 2007, ISSN 1748-7838, S. 471–482, doi:10.1038/cr.2007.40, PMID 17486124.

[10] Chikako Nishitani, Narumi Hirai, Sadao Komori, Masato Wada, Kazuma Okada: Efficient Genome Editing in Apple Using a CRISPR/Cas9 system. In: Scientific Reports. Band 6, 2016, ISSN 2045-2322, S. 31481, doi:10.1038/srep31481, PMID 27530958, PMC 4987624 (freier Volltext).

[11] Ikuko Nakajima, Yusuke Ban, Akifumi Azuma, Noriyuki Onoue, Takaya Moriguchi: CRISPR/Cas9-mediated targeted mutagenesis in grape. In: PloS One. Band 12, Nr. 5, 2017, ISSN 1932-6203, S. e0177966, doi:10.1371/journal.pone.0177966, PMID 28542349, PMC 5436839 (freier Volltext).

[12] Peter Schopfer: Pflanzenphysiologie. Elsevier, Spektrum Akademischer Verlag, München 2010, ISBN 978-3-8274-2351-1, S. 382–383.

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