Der deutsche Formel-3-Cup 2013 (ATS Formel-3-Cup) war die 39. Saison der deutschen Formel 3. Die Saison begann am 27. April in Oschersleben und endete am 29. September auf dem Hockenheimring. Insgesamt wurden neun Rennwochenenden ausgetragen. Marvin Kirchhöfer gewann die Fahrerwertung.
Wie im Vorjahr wurden neun Veranstaltungen ausgetragen. Pro Wochenende wurden je drei Rennen ausgetragen. Bis auf drei Ausnahmen fanden alle Rennwochenenden im Rahmen des ADAC Masters Weekend statt: Das erste Rennwochenende auf dem Nürburgring wurde im Rahmen des 24-Stunden-Rennens ausgetragen. Das erste Rennwochenende auf dem EuroSpeedway Lausitz und das zweite Rennwochenende in Oschersleben wurden im Rahmenprogramm der DTM stattfinden.
Die Veranstaltungen in Zandvoort, Assen und Spielberg gehörten in diesem Jahr nicht mehr zum Rennkalender. Stattdessen fanden je zwei Rennwochenenden auf dem Nürburgring, dem EuroSpeedway Lausitz und in Oschersleben statt.